python命令行传参执行脚本报错_Python脚本命令行传参方式

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在运行Python脚本时需要传入参数，例如species和folds，可以使用2种方式

python script.py ecoli 10

python script.py -s ecoli --folds 10

这2种格式对应不同的参数解析方式，分别为sys.argv、argparse。两者都是python内置包。

1. sys.argv

sys模块较为常用，它封装了与python解释器相关的数据。例如，sys.modules里存储已经加载的所有模块的信息，sys.path里是PYTHONPATH的内容，而sys.argv封装了传入的参数数据。

使用sys.argv接收上面第一个命令中包含的参数，方式如下：

import sys

species = sys.argv[1] # 第一个参数

folds = sys.argv[2] # 第二个参数

print(f'species = {species}')

print(f'folds = {folds}')

2. argparse

使用argparse包对输入参数进行解析，方式如下：

import argparse

parser = argparse.ArgumentParser(description='Demo of argparse')

parser.add_argument('-s', '--species', type=str, default='ecoli', help='ecoli, scere')

parser.add_argument('-f', '--folds', type=int, default=50, help='10, 30, 50, 75, 100')

args = parser.parse_args()

species = args.species

folds = args.folds

print(f'species = {species}')

print(f'folds = {folds}')

parser.add_argument方法的type参数一般只使用bool、int、str、float等基本类型，复杂类型可以通过str传入，再手动解析。

bool类型传入后的解析比较特殊，传入任何值都会被解析成True，传入空值时才为False。

argparse.ArgumentParser中的description是脚本整体描述，各argument中的help是各个参数的描述。用-h或--help查看，如下图：