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本节介绍如何在您的计算机上安装Biopython.它非常容易安装,不会超过五分钟.
第1步 : 验证Python安装
Biopython旨在与Python 2.5或更高版本一起使用.因此,必须首先安装python.在命令提示符中运行以下命令 :> python --version
它的定义低于 :
如果安装正确,它会显示python的版本.否则,下载最新版本的python,安装它然后再次运行命令.
步骤2 : 使用pip安装Biopython
在所有平台上使用命令行中的pip很容易安装Biopython.输入以下命令 :> pip install biopython
屏幕上会显示以下响应 :
用于更新旧版本的Biopython :> pip install biopython --upgrade
屏幕上会显示以下响应 :
执行此命令后,将删除旧版本的Biopython和NumPy(Biopython依赖于它),然后再安装最新版本.
第3步 : 验证Biopython安装
现在,您已在计算机上成功安装了Biopython.要验证是否正确安装了Biopython,请在python控制台上键入以下命令 :
它显示了Biopython的版本.
Alternate Way : 使用Source安装Biopython
要使用源代码安装Biopython,请按照以下说明 :
从下载最新版本的Biopython以下链接 : https://biopython.org/wiki/Download
下载文件并解压缩压缩存档文件,进入源代码文件夹并输入以下命令 :> python setup.py build
这将从下面给出的源代码构建Biopython :
现在,使用以下命令测试代码 :> python setup.py test
最后,使用以下命令安装 :> python setup.py install
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