r语言remarkdown展示图_R语言绘制弦图（Chord diagram）

最新推荐文章于 2024-03-29 13:45:14 发布
最新推荐文章于 2024-03-29 13:45:14 发布
阅读量1.6k 收藏 5
点赞数
文章标签： r语言remarkdown展示图
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_39609822/article/details/112206055
版权
e3a5126c16a5807b1360ad6f93fb2284.gif

夏日记忆

d204b4b0b89f8cee9f448bfd3ad6cea3.png

题外话，据说南京大学由于众多学生在知乎吐槽，于今日上了知乎热搜，校园领导迫于舆论压力，解封校园，我小破农何时才能解封？我们翘首以盼

一般我们绘制微生物相对丰度除了利用柱状图之外还可以用弦图，以此类推绘制不同的来源的环境因子也可以利用弦图来表示。2019年浙江大学动物科技学院王佳堃团队在线发表在Biotechnology for Biofuels的一篇文章《Metatranscriptomics of the Hu sheep rumen microbiome reveals novel cellulases》就利用弦图很好的掩饰了不同功能的碳水化合物活性酶的来源(门水平的贡献度)，因此本文同样利用R有语言演示此图的绘制过程，感兴趣的同学可以私信我，所求示例文件。 a44fa48f83f5238830c5e92b171ef5f3.png
最低0.47元/天 解锁文章
weixin_39609822
关注
  • 0
    点赞
  • 踩
  • 5
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
采用R绘制弦图
Mrrunsen的博客
01-31 1639
弦图是一种用于描述节点之间关系的图表，属于流可视化类型的一种，在专利分析中可用于展示多个国家/地区的多边专利关系，或多个申请人之间的专利合作情况。在之前的公众号里，介绍了如何采用python绘制弦图的方法（相关链接：作图详解 | 利用Python绘制弦图），实际上，R绘制的弦图也很好看呢。 STEP 1 数据准备 以多边国家申请流向关系为例，准备相应Excel或csv表格，下表内数据为随机数。 STEP 2 绘制弦图 读入上述表格，安装绘制弦图的“circlize”包，并绘制弦图
【数据可视化应用】绘制和弦图（附Python和R语言代码）
wenyusuran的专栏
02-27 5160
和弦图(Chord diagram)简介 和弦图(chord Diagram)，是一种显示矩阵中数据间相互关系的可视化方法，节点数据沿圆周径向排列，节点之间使用带权重（有宽度）的弧线链接。其适合节点数据集或边数据集，功能为观察数据节点之间的关系。此类图主要将数据权重映射到节点和边的宽度，适合多组数据进行绘制。和弦图的结构大致如下： 和弦图结构(图片来源于网络，侵删) 下面就具体介绍下使用R和Python进行和弦图(chord Diagram)的绘制。 和弦图(Chord diagram)绘制方法
R语言可视化绘图_弦图.txt
08-30
本资源为R语言可视化绘图代码资源——弦图代码，相比柱状图，弦图表达显得更高大上
超全面！和弦图(Chord diagram) 的绘制方法汇总~~
最新发布
qq_40483688的博客
03-29 2367
和弦图(chord Diagram)，是一种显示矩阵中数据间相互关系的可视化方法，节点数据沿圆周径向排列，节点之间使用带权重（有宽度）的弧线链接。其适合节点数据集或边数据集，功能为观察数据节点之间的关系。此类图主要将数据权重映射到节点和边的宽度，适合多组数据进行绘制。和弦图的结构大致如下：和弦图结构(图片来源于网络，侵删)下面就具体介绍下风别使用R和Python进行和弦图(chord Diagram)的绘制。本篇推文介绍了和弦图(Chord diagram)的R和。
R语言如何绘制弦图（25）
qq_35294674的博客
05-30 4325
1.什么是弦图？ 弦图（chord diagram）又称和弦图。可以显示不同实体之间的相互关系和彼此共享的一些共通之处，因此这种图表非常适合用来比较数据集或不同数据组之间的相似性。节点围绕着圆周分布，点与点之间以弧线或贝塞尔曲线彼此连接以显示其中关系，然后给每个连接分配数值（通过每个圆弧的大小比例表示）。此外，也可以用颜色将数据分成不同类别，有助于进行比较和区分。 弦图的特点在于，它有助于我们看出数据之间的关系，适用于比较数据集或不同数据组之间的相似性。连接两个数据点的弧线可以以颜色、弧线与圆的接触面积大小
R语言绘制简单相关弦图教程
Mrrunsen的博客
07-22 341
在R语言中，相关弦图（Correlation Chord Diagram）是一种用于可视化多个变量之间的相关关系的图形。相关弦图通过弦连接变量，弦的宽度和颜色表示相关系数的大小和正负方向。这种图形有助于理解变量之间的相关性，特别适用于分析多个变量之间的复杂关系。在本教程中，我们将使用R语言中的circlize包来绘制简单的相关弦图。我们将使用R语言内置的mtcars数据集来演示绘制相关弦图的步骤。
Python库 | matplotlib_chord_diagram-0.0.4-py2.py3-none-any.whl
03-31
资源分类：Python库 所属语言：Python 资源全名：matplotlib_chord_diagram-0.0.4-py2.py3-none-any.whl 资源来源：官方 安装方法：https://lanzao.blog.csdn.net/article/details/101784059
dht.zip_DHT C_algorithm chord_chord_chord D_chord algorithm
09-23
chord算法研究和分析，很好的一个pdf文档的
chord measurement.rar_三点法 函数_三点法 弦_传递函数_弦测法
07-14
三点偏弦测法理论说明文献 弦测法传递函数及黄金分割点遍历程序
peersim(chord).rar_chord_chord P2P
09-22
p2p经典的架构chord在peersim中的实现
区间图、弦图和完美图
04-23
详细讲诉了区间图、弦图和完美图\完美消除序列
Origin | 比例弦图 (Chord Diagram) | 比例弦图与弦图的区别
跳动的喵尾巴
05-07 1万+
Origin绘制弦图，弦图与比例弦图的区别
用R绘制弦图
热门推荐
Christina
09-03 1万+
方法一：R绘制 # 两个包自己用Rstudio直接安装就好 library(statnet) library(circlize) 数据导入 # setwd（...）# 自己设定工作环境，随自己喜好 # Rmd无需设置工作目录，默认为文件所有目录 data<-read.csv("SC.csv",header=T,row=1) my.data<-as.matrix(data) # 矩阵化 # 手动设置行列名（可选） rownames(my.data) <-c("CCK", "CN.
R语言如何绘制弦图
Mrrunsen的博客
07-30 490
弦图是一种可视化方法，用于展示两个或多个类别之间的关系。在弦图中，每个类别表示为一个扇形，而类别之间的关系表示为连接它们的弦。这将绘制一个基本的弦图，其中每个类别表示为一个扇形，而类别之间的关系表示为连接它们的弦。则可以将该矩阵存储为一个名为。在R语言中，您可以使用。
R语言弦图绘制 （单细胞互作弦图）
qq_42090739的博客
10-17 1755
弦图是一种非常常见的图形，表示互作联系，远的不说，就近期一直说的单细胞互作关系的展示上，弦图露了很多次面！这里我们举个例子，说说简单的弦图绘制！首先准备互作数据，设置颜色，有几个项目就设置几种颜色。这里弦图的绘制采用的是circlize包的chordDiagram函数。更多精彩请至我的公众号--KS科研分享与服务！还可以将弦取消，使用箭头连接，更加明了，连接线宽度设置数值，表示互作关系的强弱。最后，我们添加上标题和legend就完成了！
R 数据可视化 —— circlize 和弦图
dxs18459111694的博客
11-22 451
和弦图可以用连接线或条带的方式展示不同对象之间的关系连接，可以直接显示不同对象之间存在关系连接的宽度与关系的强度成正比连接的颜色可以代表关系的另一种映射，如关系的类型扇形的大小，代表对象的度量在circlize，并不需要使用来一个个绘制。
R语言绘图--高级图形之Chord
晏九的博客
08-09 6535
Chord图： R包：Circlize包 实现了圆形布局用于可视化展示大量信息，此包可以使用户灵活使用基本图形便于实现自定义的高级图形， 同时拥有专门绘制基因组学相关图形的功能。 实现： library(circlize) library(Cairo) bed1 = generateRandomBed(nr = 100) bed1 = bed1[sample(nrow(bed1), ...
在线画图工具-chord diagram和弦图
五月的田野
04-27 1万+
网站：http://www.qplot.cn:3838/sample-apps/005-chord_diagram/ 和弦图（chord），根据弧度大小反应样本与OTU之间的数量关系，根据中间颜色的对应关系，直观的看出样本与OTU的丰度关系 使用教程：导入表格 示例： 更多画图工具： http://www.qplot.cn:3838/sample-apps 使用问...
R语言绘制弦状图
dltan
03-31 8772
1.数据 2.程序代码 library(statnet) library(circlize) data<-read.csv("Bacteria otu.csv",header = T,row=1) my.data<-as.matrix(data) row.names(my.data)<-c("A1","B1","C1","D1") colnames<-c("Pro...
R绘制九个变量之间的弦图，根据权重不同调整宽度，并且输出为pdf
06-02
好的，我可以帮你解决这个问题。首先，你需要安装 `circlize` 包来绘制弦图，可以使用以下命令进行安装： ```r install.packages("circlize") ``` 接下来，你需要准备数据，假设你有一个九个变量之间的权重矩阵 `weights`，那么你可以使用以下代码将其转化为弦图需要的数据格式： ```r library(circlize) # 将权重矩阵转化为弦图需要的数据格式 mat = weights rownames(mat) = colnames(mat) = letters[1:9] mat = mat[order(rownames(mat)), order(colnames(mat))] # 计算每个变量对应的角度范围 theta = diff(c(0, cumsum(mat))) theta = theta / sum(theta) * 2 * pi # 绘制弦图 pdf("chord_diagram.pdf") chordDiagram(mat, transparency = 0.5, directional = 1, col = colorRamp2(c(0, 1), c("#BB4444", "#66CCEE")), annotationTrack = "grid", preAllocateTracks = 1, grid.col = "grey", grid.lwd = 0.5, grid.lty = 2, annotationTrackHeight = 0.03, link.arr.type = "big.arrow", link.sort = TRUE, link.largest.ontop = TRUE, link.largest.ontop.col = "red", link.width = apply(mat, 1, sum) * 3) dev.off() ``` 在上述代码中，我们使用 `chordDiagram()` 函数绘制弦图，其中 `mat` 是我们转化后的数据矩阵，`theta` 是每个变量对应的角度范围，`pdf()` 函数用于将图像输出为 PDF 格式。 在 `chordDiagram()` 函数中，我们可以通过 `link.width` 参数来调整弦的宽度，这里我们使用了每个变量对应的入度和出度之和作为弦的宽度。 最后，你可以通过修改代码中的 `weights` 矩阵来绘制不同的弦图，也可以根据需要调整其他参数来达到更好的可视化效果。

“相关推荐”对你有帮助么？

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值