本文介绍了在Ubuntu 18系统中如何升级R到3.5以上版本，安装必备包，以及如何在R环境中安装shiny-server和Rstudio-server。接着详细阐述了安装三个重要的R包——scater, Seurat和monocle的过程，这些R包是进行单细胞分析的关键。当遇到R包安装失败时，提示可能由于缺少Linux系统库文件导致，建议自行安装缺失的系统库。最后，文章提及了生信技能树的单细胞分析线下培训课程信息。"
109288359,9566500,Kafka高可用集群实践：基于Zookeeper的搭建与管理,"['Kafka', 'Zookeeper', '集群', '高可用', '消息队列']
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cat /etc/issue
通常来说，很多R包的安装对R版本是有要求的，比如BiocManager需要 R (≥ 3.5.0)，但是并不需要最新版R语言。
R到3.5因为引入了Bioconductor version: Release (3.8)，是一个破天荒地的改变，所以低版本的R必须更新到3.5以上！
Ubuntu倒是很稳定的更新，我的其实已经是Ubuntu18了 ，其它版本需要修改Ubuntu源文件，使用VIM编辑器修改文件：/etc/apt/sources.list
假如系统R版本不够，就需要升级
# 首先删除系统自带旧版本的R
sudo apt-get --purge remove r-base r-base-core r-base-dev
sudo apt-get --purge remove r-base-core
sudo apt-get --purge remove r-base-dev
# sudo apt-get remove -y 'r-cran-*'
# apt-get remove 会删除软件包而保留软件的配置文件r
# apt-get purge 会同时清除软件包和软件
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