ubuntu安装gnutls_在Ubuntu下安装旧版seurat

演示如何配置单细胞数据处理环境。

先准备Ubuntu系统

这里首推华为云：https://www.huaweicloud.com/pricing.html#/ecs

可以和其它按需购买的云服务对比：

https://www.amazonaws.cn/ec2/pricing/ec2-linux-pricing/ (亚马逊中国，aws)

https://buy.cloud.tencent.com/price/cvm#tab0-list1 (腾讯云服务器)

https://cn.aliyun.com/price/product#/ecs/detail (阿里云服务器)

https://cloud.google.com/compute/pricing?hl=zh-CN (谷歌云服务器)

其它，美团云，百度云等等就不一一展示

安装R语言

假如系统R版本不够，就需要升

# 首先删除系统自带旧版本的R

sudo apt-get --purge remove r-base r-base-core r-base-dev

sudo apt-get --purge remove r-base-core

sudo apt-get --purge remove r-base-dev

# sudo apt-get remove -y 'r-cran-*'

# apt-get remove 会删除软件包而保留软件的配置文件r

# apt-get purge 会同时清除软件包和软件的配置文件

#然后更新Ubuntu源文件

## 这里，不同Ubuntu系统有点不一样：

cat /etc/issue

# 18.04

# 使用VIM添加下面代码到/etc/apt/sources.list文件

# deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/

sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E084DAB9

sudo apt-get update

sudo apt-get install -y r-base r-base-core r-base-dev

安装shiny-server及Rstudio-server

https://www.rstudio.com/products/shiny/shiny-server/

https://www.rstudio.com/products/rstudio/download-server/

sudo su - \

-c "R -e \"install.packages('shiny', repos='https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/')\""

sudo apt-get install gdebi-core

wget https://download3.rstudio.org/ubuntu-14.04/x86_64/shiny-server-1.5.9.923-amd64.deb

sudo gdebi shiny-server-1.5.9.923-amd64.deb

wget https://download2.rstudio.org/server/trusty/amd64/rstudio-server-1.2.1335-amd64.deb

sudo gdebi rstudio-server-1.2.1335-amd64.deb

这样的话 http://139.9.249.168:3838/ 和 http://139.9.249.168:8787 就是可以访问的啦，不过在华为云上需要开通指定的端口。

安装旧版seurat的依赖包

如何知道旧版seurat的依赖包呢？先运行：

packageurl