python文件写入字典格式输出_将字典值(列表)写入输出文件Python

我试图将字典中的值(列表)打印到另一个文件的第三列,该文件在第一列中包含dictionary键。我希望在输出文件的第三列打印值列表,并用空格分隔每个值。我知道我的问题在于Python不能写非字符串的东西,列表用“,”分隔,但我对编程还不熟悉,不知道如何实现这一点-非常感谢任何帮助,谢谢!在

在GtfFile.txt文件是一个10列的文件(sep='\t'),我从中生成字典。。。使用基因名作为关键字,以术语(功能类别)作为值。有几个基因有不止一个术语归属于它们,并作为每个术语的新线重复。每个术语都有不同数量的基因,因此我生成一个列表作为每个术语的关键字。我的脚本的这一部分看起来像我希望的那样工作!在

Funcern酒店_术语.txt是一个2列文件(sep='\t'),它由第一列中的术语和第二列中的术语描述组成。我想要的输出文件是用第三列复制这个文件,其中包含与用空格隔开的术语相关的基因。将此写入输出文件是我的问题所在。在

以下是我的代码:#!/usr/bin/env python

import sys

from collections import defaultdict

if len(sys.argv) != 4 :

print("Usage: GeneSetFileGen.py ")

sys.exit(0)

OutFileName = sys.argv[3]

OutFile = open(OutFileName, 'w')

TermGeneDic = defaultdict(list)

with open(sys.argv[1], 'r') as f :

for line in f :

line = line.strip()

line = line.split('\t')

Term = line[8]

Gene = line[0]

TermGeneDic[Term].append(Gene)

#write output file

with open(sys.argv[2], 'r') as f :

for line in f :

line = line.strip()

Term, Des = line.split('\t')

OutFile.write(Term + '\t' + Des + '\t' + str(TermGeneDic[Term]) + '\n')

OutFile.close

  • 0
    点赞
  • 0
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值