graphpad prism显著性差异分析_Graphpad官网升级完成听说,新功能远超R语言

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GraphPad Prism是一款高效易用的科研绘图工具,集生物统计、曲线拟合和科技绘图于一体,还可用于Windows和Mac操作系统,在生物学以及社会和物理科学界得到广泛使用。 事物都在不断发展与进步, 2020年10月30日,Graphpad公司隆重推出了Graphpad Prism的全新版本Graphpad Prism 9(以下简称Prism 9)! ad3019fb756aa5543ea25e4e850a4f6d.png 总的来说,Prism 9与Prism 8很相似,很容易上手,所以广大熟练使用Prism 8的用户可以无缝对接到Prism 9。 相同点无需赘述,那么作为最新版本的Prism 9新在哪里?接下来就让我们一起来围观Prism 9的新功能吧!

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更加智能,自动添加多结果统计学差异

在某科研论坛上有一个问题,横线表示p值,可以在prism软件中画出,那每根柱子上面的线表示什么意思,怎么用Prism画出来? 14e80212ada1f008f97ca80b818fe8d5.png 在Prism 9中只需鼠标单击一次既可自动连线并将统计结果添加到图形中,工作效率得到极大的提高: 2d2583f8053020475594d4511f5f150f.png 使用步骤: 1. 打开Prism 9,New table & graph选择Column,输入示例数据: 48a32657e438886a7f42f4e2d616170c.png 2. Graphs下选择柱形图加散点,得到基本图形如下: c63afbfaf140b07e84b5868786fa717f.png 3. 点击Analyze,对两组数据进行相应的统计学分析,此处进行t检验,点击OK完成统计: f0e89d21b01c63bc9a081b84ab38d0f9.png 4. 点击Draw下带红色星号(*)的划线工具,即可自动添加连线与统计差异: 7f4a88736190cee8dcb67c0820b5daea.png 464e9fab68be98d4797dc0692e6f0b40.png 双击该工具可以对显示的颜色等信息进行设置,例如Display options可以设置显示具体的p值或星号,Line/bracket and text options可以设置组间连线的粗细及颜色等。此外对存在显著性差异的p值阈值进行设置——P value threshold: e6bbd42457fa07157328d5b35a627b6d.png 单因素方差分析的自动标记方法与前述类似: e03d5949f97146e4a31375fd93af3f64.png 有一个小问题,如果我不想显示没有差异的比较该怎么办? 那么请双击自动划线工具,点击Comparisons on graph,不勾选不想显示的比较两组,即可去除画线与ns: 7b95085c8dccc4050d2cd343f3faabd4.png a9bb4fd1e9e40c27e067e03640959dd0.png

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新的图形,气泡图和评估图

气泡图(bubble plot):可显示多元变量数据,可清晰的呈现多个数据之间的关系。例如,下图显示了X、Y,气泡大小与颜色多元变量之间的关系: 43da38984773737a77ff3e1efc5df99d.png 基本步骤为: 1. 打开Prism 9,New table & graph选择Multiple variables,输入数据:   e655a44d6fbe1c8b8570803eb21bcb17.png c766ef076cd4687d4bf6a482b3c4c372.png 2. 在Create New Graph下的Kind of show选择Bubble Plot,分别选择X轴、Y轴、气泡大小与颜色对应的变量,点击OK即可得到气泡图,后续进行美化与调整: 447f6a017b4da3f2a00034690be7404a.png 4ae118234a0534fe2ffcb70a9878335b.png 3. 双击气泡进入Format Graph, Fill Color中Prism 9提供了多种配色方案:Plasma、Viridis、Magma等。 d3bddeb6c23ad755b1f3ab49505fb7b2.png 712e396bfeeed426872f12d9fff3ce8a.png 从t检验生成评估图(estimation plot):该图形左侧散点显示了Male与Female的原始数据,右侧显示了效应量(平均数差值)及其95%置信区间的大小。 如下图所示:如果效应量95%Cl包括0则p>0.05,如95%Cl不包括0,则p<0.05。需要引起注意的是,目前从t检验生成评估图只适用于t检验(非配对t检验和配对t检验)。 3f282d5aed6cfafe299522b89e8df826.png 基本步骤为: 1. 打开Prism 9,输入数据得到图形后,点击Analyze进行统计学分析,进行t检验: 53612d5d4edae3b8f817c3d1e4f4457b.png 2. t检验时进行参数设置,Graphing options处就可以设置是否显示95%置信区间与效应量: eb7a35e2d4aa1664db54bb5552c24bd7.png 6eafafe2dcacfdd9e500e491c3d4fb16.png 非线性回归的实际与预测图。残差图是指以某种残差为纵坐标,以其他适宜的量为横坐标的散点图,残差图是进行模型诊断的重要工具。非线性回归的实际与预测图可以创建五个残差图(包括新的实际与预测图),在Prism 8中只能得到一个图。五种残差图如下: c3ca521b671290dd970149ace6c3ea26.png 27f9828feae9d946bda6bf3cc7b0c479.png

3

新的分析,主成分分析(PCA)和主成分回归(PCR)

PCA是一种用于分析多变量数据的方法,可将多个指标化为少数几个综合指标的一种统计分析方法,即通过降维技术把多个变量化为少数几个主成分的方法。 2d7386fbc44640d3f73638947cc57d16.png Prism 9 PCA提供的其他功能包括: 1. 通过平行分析选择成分(以及Kaiser方法、总方差阈值法等); 2. 生成Scree图、Score图和biplot图; 3. 自动准备PCA结果,以便进一步用于多元线性回归。

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更高的数据维度

除上述更新外,Prism 9为适应大数据集的分析要求进行了一系列更新,主要涉及将数据列的上限提高至1024列,可自动识别变量类型,数据表可输入文本信息与自动变量编码等。 当然,本文也不能将Prism 9的所有新功能尽数分享给大家,有兴趣的小伙伴可以去What's new in Prism 9进行学习与探索:https://www.graphpad.com/guides/prism/latest/user-guide/new-organization.htm! 42fd25e3debdaf5f7484dd7dec08d045.png 大家看了这么多新功能是不是在想,我缺的是新功能介绍吗?我缺的是软件!那么打开官网https://www.graphpad.com/,输入您的邮箱即可开始一段为期30天的与Prism 9的“浪漫旅行”! 232b4919471c6769732102121fb2a729.png

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### 回答1: GraphPad Prism是一款统计学软件,可用于分析显著性差异。它可以进行t检验、单因素方差分析、多因素方差分析等多种统计检验,并可视化输出结果。使用该软件可以帮助研究者确定两组或多组数据之间是否存在显著差异。 ### 回答2: GraphPad Prism是一款功能强大的统计分析软件,可以帮助科研工作者进行高效的数据分析和可视化呈现。其中一个常用的功能就是显著性差异分析,以下将详细介绍该功能的使用方法和解读结果。 一、显著性差异分析的步骤 1. 数据输入:首先,在 GraphPad Prism软件中,我们需要将待分析数据输入到数据表格中。在输入数据时,需要注意数据的格式和类型是否符合要求,如数据类型、变量类型等。同时,我们还可以利用软件的“Data Checklist”功能数据进行检查,以确保数据无误。 2. 变量分组:接着,我们需要将数据按照实验组别分成不同的变量或子集。这一步操作可以在数据表格中实现,并且可以设置变量名称、标注等。分组时需要注意,组别之间需要明确的分类标准,如治疗组、对照组等。 3. 数据分布检查:在进行显著性差异分析之前,我们需要首先对数据的分布进行检查,以确定使用何种分析方法。这一步可以通过软件的“Descriptive Statistics”功能实现,可以了解数据的中心趋势、离散程度、峰度、偏度等统计指标。 4. 统计方法选择:根据数据的分布情况和实验设计的需要,我们选择合适的统计方法进行分析GraphPad Prism提供了多种统计方法,包括t检验、方差分析、卡方检验、线性回归等,这些方法适用于不同类型的数据和实验设计。 5. 结果解读:最后,我们需要对分析结果进行解读,并用图表直观呈现,可以选择支持显著性差异分析的统计图表,如柱状图、折线图、散点图等。 二、显著性差异分析的结果解读 在 GraphPad Prism软件中进行显著性差异分析后,会得到一系列统计指标和P值,这些指标可以帮助我们判断实验组别之间的显著性差异。 1. 统计指标 常用的统计指标包括均值、标准差、标准误、置信区间、95%置信区间等。这些指标可以用于描述数据的分布情况和中心趋势。 2. P值 P值是显著性差异分析中的重要指标之一,表示数据之间的差异是否有统计学意义。P值越小,代表差异越显著,一般以0.05或0.01作为显著性水平来判断差异是否显著。 3. CL值 除了P值外,CL值也是一个常用的统计指标。CL值代表差异范围的可信程度,通常以95%的置信区间来表示。如果CL值不包含“0”,则说明差异显著;如果包含“0”,则说明差异不显著。 三、常用的显著性差异分析方法 1. t检验 t检验是用于比较两个样本平均值是否显著不同的方法,适用于正态分布或近似正态分布的数据。t检验包括独立样本t检验和配对样本t检验两种形式,具体应用根据实验的设计和数据的类型来选择。 2. 方差分析 方差分析是一种广泛应用于比较两组或多组平均值是否存在显著差异的方法,主要适用于多个组别的数据。方差分析可以根据实验设计的不同,分为单因素方差分析、多因素方差分析和重复测量数据的方差分析等多类方法。 3. 卡方检验 卡方检验是用于比较两个分类变量是否显著相关的方法,适用于分类数据或计数数据分析。卡方检验包括卡方独立性检验和卡方拟合优度检验等多种形式,具体应用也要根据实验设计和数据的类型来选择。 四、总结 在科研实验中,显著性差异分析是必不可少的一个步骤,能够帮助我们判断实验组别之间的差异是否显著,为科研工作者提供了重要的统计支持。GraphPad Prism显著性差异分析功能简单易用,方便快捷,不需要编写复杂的统计代码,适用于各种类型的数据和实验设计。但我们需要注意选择合适的分析方法和解读统计指标,同时还要根据实验的具体设计和目的合理运用。 ### 回答3: GraphPad Prism是一款广泛用于统计分析的软件,其中最常用的是显著性差异分析显著性差异分析可以用来判断两个或多个数据组之间是否存在显著性差异。当数据集之间存在显著性差异时,我们可以在这些数据之间进行有意义的比较和探索。 在GraphPad Prism中,有多种方法可以用于显著性差异分析,如方差分析(ANOVA)、t检验、Mann-Whitney U检验等。这些方法的选择取决于数据分布的类型和样本之间的关系。对于双变量数据,常用的t检验可以判断两组均值是否有显著性差异,而对于多个数据组之间的比较,则需要使用ANOVA方法。Mann-Whitney U检验则适用于非正态分布的数据。 在GraphPad Prism中,显著性差异分析结果包括统计值和p值。统计值通常是t值、F值或U值,用于衡量数据之间的差异程度。p值则用于判断差异是否具有显著性。通常认为p值小于0.05(或0.01)时具有显著性差异。 除了上述基本方法外,GraphPad Prism中还包括多种高级分析技巧,如多重比较、配对检验、线性回归等方法,可以更全面地了解并分析数据之间的关系。同时,GraphPad Prism还提供了直观的可视化图表,如柱状图、折线图和散点图等,可以直观地展示不同数据组之间的差异和关系。 总而言之,GraphPad Prism是一款强大的统计分析软件,可以用于各种类型的显著性差异分析,并且提供了多种高级分析方法和可视化图表,帮助用户更全面地了解和探索数据之间的关系。

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