python读取hdf5文件_python-h5py：如何读取hdf5文件的选定的行？

我有一个样本h5py文件,其中：

data = f['data']

#

# is arange(18).reshape(3,6)

ind=np.where(data[:]%2)[0]

# array([0, 0, 0, 1, 1, 1, 2, 2, 2], dtype=int32)

data[ind] # getitem only works with boolean arrays error

data[ind.tolist()] # can't read data (Dataset: Read failed) error

最后一个错误是由列表中的重复值引起的.

但是使用具有唯一值的列表建立索引可以很好地工作

In [150]: data[[0,2]]

Out[150]:

array([[ 0, 1, 2, 3, 4, 5],

[12, 13, 14, 15, 16, 17]])

In [151]: data[:,[0,3,5]]

Out[151]:

array([[ 0, 3, 5],

[ 6, 9, 11],

[12, 15, 17]])

具有适当维数切片的数组也是如此：

In [157]: data[ind[[0,3,6]],:]

Out[157]:

array([[ 0, 1, 2, 3, 4, 5],

[ 6, 7, 8, 9, 10, 11],

[12, 13, 14, 15, 16, 17]])

In [165]: f['data'][:2,np.array([0,3,5])]

Out[165]:

array([[ 0, 3, 5],

[ 6, 9, 11]])

In [166]: f['data'][[0,1],np.array([0,3,5])]

# errror about only one indexing array allowed

因此,如果索引正确-唯一值,并且与数组尺寸匹配,它应该可以工作.

我的简单示例未测试加载了多少数组.文档听起来好像是从文件中选择了元素,而没有将整个数组加载到内存中.