h5后缀文件python处理

文件的结构为组+数据集
其中组可以是多级的，类似文件夹的目录关系。

首先打开对应文件：

// An highlighted block
import h5py
import numpy as np
from PIL import Image

h5_file = "D:/GoProEvent/GOPRO/GOPRO/train/GOPR0372_07_00.h5"
file = h5py.File(h5_file, "r")
groups = [key for key in file.keys()]
print("该文件共有以下几组：", groups)

输出结果：

用file[‘group’]来“打开对应目录”
如果是多级group可以将相关信息打印出来查看：

// An highlighted block
h5_file = "D:/GoProEvent/GOPRO/GOPRO/train/GOPR0372_07_00.h5"
file = h5py.File(h5_file, "r")
groups = [key for key in file.keys()]
print("该文件共有以下几组：", groups)
a = file['masks']
agroup = [key for key in a.keys()]
print("该文件共有以下几组：", agroup)

输出结果：

通过对应的组别名称获取相应的数据：
对数据所在的group进行操作，对应以上代码即‘mask000000000’内获取数据。可以理解为名称为mask000000000的文件内的东西就是你要数据。(这里也可以理解为图像，只不过你需要的不是图像，而是图像内的像素集合)

// An highlighted block
for fg in a:
    print("group:"+fg)
    print(file['masks'][fg][:].shape)
    img = file['masks'][fg][:]
    print(img)

部分输出：

得到数据后，利用PIL依赖将数据保存为图片格式。

// An highlighted block
conut = 0
for fg in a:
    print("group:"+fg)
    print(file['masks'][fg][:].shape)
    img = file['masks'][fg][:]
    #print(type(img))
    save_path = 'D:/GoProEvent/masks/' + str(conut) + ".png"
    img = img.swapaxes(0, 1) //调整维度顺序
    img = img.swapaxes(1, 2)
    img = np.squeeze(img)
    print(img.shape)

    img = Image.fromarray(np.uint8(img)).convert("L")//针对单通道处理
    img.save(save_path)
    conut = conut + 1

需要注意的是给出的例子是一个单通道的灰度图。针对图像处理的Image.fromarray()函数貌似只能处理3通道或者是二维数组，所以利用img = np.squeeze(img)对通道数进行了处理。同时需要对初始数据维度进行校准，需要将维度顺序改为 HWC

如果需要对三通道进行处理，修改部分代码为：展示所有代码

// An highlighted block
import h5py
import numpy as np
from PIL import Image

h5_file = "D:/GoProEvent/GOPRO/GOPRO/train/GOPR0372_07_00.h5"
file = h5py.File(h5_file, "r")
groups = [key for key in file.keys()]
print("该文件共有以下几组：", groups)
a = file['masks']
conut = 0
for fg in a:
    print("group:"+fg)
    img = file['masks'][fg][:]
    save_path = 'D:/GoProEvent/masks/' + str(conut) + ".png"
    img = img.swapaxes(0, 1)
    img = img.swapaxes(1, 2)
    img = Image.fromarray(np.uint8(img))
    img.save(save_path)
    conut = conut + 1