python中e库是干什么的_用Python做生存分析--lifelines库简介

Python提供了一个简单而强大的生存分析包——lifelines，可以非常方便的进行应用。这篇文章将为大家简单介绍这个包的安装和使用。

安装

lifelines支持用pip的方法进行安装，您可以使用以下命令进行一键安装：

pip install lifelines

使用简介

在python中，可以利用lifelines进行累计生存曲线的绘制、Log Rank test、Cox回归等。下面以lifelines包中自带的测试数据进行一个简单的示例。

一、绘制S(t)

首先加载和使用自带的数据集：

from lifelines.datasets import load_waltons

from lifelines import KaplanMeierFitter

from lifelines.utils import median_survival_times

df = load_waltons()

print(df.head(),'\n')

print(df['T'].min(), df['T'].max(),'\n')

print(df['E'].value_counts(),'\n')

print(df['group'].value_counts(),'\n')

运行一下将会看到以下结果，

运行结果

数据有三列，其中T代表min(T, C)，其中T为死亡时间，C为观测截止时间。E代表是否观到“死亡”，1代表观测到了&#