单通道图像保存_3D图像展示篇结构更清晰

3D图像展示

之前的帖子中提到了3D图像的各种采集方法，我们获取Z-Stack图像后需要选择适合图像的展示模式，让大家可以直观的了解样品结构。

3D扫描基础篇--结构更清晰

3D扫描Plus--厚样品补光采集

3D扫描Pro--多点时间三维序列采集

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主视图

NIS-Elements的文件默认打开视图，下方显示Z轴状态栏，可拖动选择显示不同高度的图像，也可自定义速度播放Z序列图像。

点击鼠标右键可添加图片ND信息，save as为视频文件，视频按照Z序列播放。

slice视图

显示三维图像的XY、XZ、YZ剖面图

Tiled 视图

Z序列图像平铺展示

Maximum/Minimum Intensity Projection 视图

3D图像中每个XY坐标对应若干个Z坐标信息，包含相应的若干个荧光强度值，选取其中的最大/最小值，生成的新的图像即最大/最小投影图。

获取投影图

在Maximum/Minimum Intensity Projection 视图下点击保存并不能得到最大/小投影的图像，保存的仍是原文件。若想获取投影图，可通过Edit-Creat view snapshot获取图像，但该图像是8bit RGB图像，丢失了原有通道信息和灰度值强度信息。

可通过Edit-Creat new document from current view获取nd2文件，保留通道信息。

Volume 视图

Z-Stack图像三维重建，立体展示，鼠标左键可旋转信号角度，右键拖移信号位置，滚轮缩放目标信号。也可打开Volume Options窗口，使用View Angle调整到特定角度。

Volume可选择不同渲染模式，常用的模式主要有Alpha和MaxIP。

Alpha使用吸光的物理原理，使物体表面更加突出。

MaxIP图像中只显示具有z序列最高强度值的像素。

Depth Coded Alpha 垂直于Z轴平面的颜色渐变，适用于单通道图像，多通道图像会丢失通道颜色信息。

获取Volume 视图图像

Edit-Creat view snapshot获取图像

获取Volume视频

Volume视图下点击

 按钮进入视频制作窗口，旋转信号到合适的角度添加第一帧，按照需要从右侧拖动添加动作模式，可添加多个；点击

   按钮生成视频，保存为avi或mp4格式。

Volume Crop

 

为了让某一结构更清晰，可以使用Volume Options窗口中Crop工具对Volume进行裁剪，

按住Ctrl键鼠标所在平面变为红色，即可拖移裁剪。 

按住Ctrl键，鼠标挪动顶部黄色锥形图标调整裁剪角度，挪动圆形图标调整裁剪位置。

裁剪前后效果对比