python fromfile_python – 压缩文件上有效的numpy.fromfile?

@Bakuriu可能是正确的,这可能是微观优化.你的瓶颈几乎肯定是IO,之后就是减压.分配内存两次可能并不重要.

但是,如果您想避免额外的内存分配,可以使用numpy.frombuffer将字符串视为numpy数组.

这避免了重复内存(字符串和数组使用相同的内存缓冲区),但默认情况下该数组将是只读的.如果需要,您可以将其更改为允许写入.

在你的情况下,它就像用frombuffer替换fromstring一样简单:

f = gzip.GzipFile(filename)

f.read(10000) # fixed length ascii header

event_dtype = np.dtype([

('Id', '>u4'), # simplified

('UnixTimeUTC', '>u4', 2),

('Data', '>i2', (1600,1024) )

])

s = f.read( event_dtype.itemsize )

event = np.frombuffer(s, dtype=event_dtype, count=1)

只是为了证明使用这种方法不重复内存:

import numpy as np

x = "hello"

y = np.frombuffer(x, dtype=np.uint8)

# Make "y" writeable...

y.flags.writeable = True

# Prove that we're using the same memory

y[0] = 121

print x #

这产生:黄色而不是你好.

无论在这种特殊情况下它是否是一个重要的优化,它都是一个有用的方法需要注意.

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