大家好,本教程将介绍如何使用R的gemtc包对生存数据(HR为效应量)进行贝叶斯网状Meta分析。
前提条件
需要下载R软件(推荐使用的R版本为3.5.3),以及RStudio(一个R的友好交互界面)。
准备工作完成后,打开RStudio后,在console里输入:
install.packages(“gemtc”)
第一次安装的时候,安装速度可能比较慢,耐心等待一下。
等安装完成后,设置我们的工作目录,后面可以把待分析的数据放入这个工作目录,敲入:
setwd("D:\\R网状教程\\HR") #你可以更改为自己的工作目录,在后面环境变量增多的时候,在这一步前可以加一个rm(list=ls())清除环境变量。
然后敲入:
library(gemtc) #装载gemtc包
关于如何将生存数据准备成可以用R的GEMTC分析的格式,以及如何计算多臂研究中参考臂的标准误,请参考如下教程:
生存数据的网状Meta分析||如何整理为可以用R的gemtc包进行分析的格式
主要分析
把刚刚准备好的数据导入到R里,敲入:
data "sample1.csv", sep=",", header=T) #sep代表逗号为分隔符,header=T代表把首行的数据作为标题,
把数据弄成gemtc的网络格式,敲入:
network #这里
输入:
plot(network)
可以看到网状图如下:
![217ae0760ef7304c8d35d123e2f82d62.png](https://img-blog.csdnimg.cn/img_convert/217ae0760ef7304c8d35d123e2f82d62.png)
当然了,这些大小、颜色、字体等等的参数都是可以调整的&#x