dbscan算法python实现_挑子学习笔记：DBSCAN算法的python实现

DBSCAN(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise)聚类算法，是一种基于高密度连通区域的、基于密度的聚类算法，能够将具有足够高密度的区域划分为簇(Cluster)，并在具有噪声的数据中发现任意形状的簇。DBSCAN算法通过距离定义出一个密度函数，计算出每个样本附近的密度，从而根据每个样本附近的密度值来找出那些样本相对比较集中的区域，这些区域就是我们要找的簇。

1. DBSCAN算法的基本原理

其它聚类方法大都是基于对象之间的距离进行聚类，聚类结果是球状的簇。DBSCAN 算法利用簇的高密度连通性，寻找被低密度区域分离的高密度区域，可以发现任意形状的簇，其基本思想是:对于一个簇中的每个对象，在其给定半径的领域中包含的对象不能少于某一给定的最小数目。

DBSCAN算法中有两个重要参数：$\varepsilon$表示定义密度时的邻域半径，$M$ 表示定义核心点时的阈值。

考虑数据集合$X= \{x^{(1)}, x^{(2)},...,x^{(n)} \}$，引入以下概念与记号。

1. $\varepsilon$邻域

设$x \in X$，称

\begin{equation*}

N_{\varepsilon}(x) = \{ y \in X: d(y,x) \le \varepsilon \}

\end{equation*}

为$X$的$\varepsilon$邻域。显然，$x \in N_{\varepsilon}(x)$。

为了简单起见，节点$x^{(i)}$与其下标$i$一一对应，引入记号

\begin{equation*}

N_{\varepsilon}(i) = \{ j: d(y^{(j)},x^{(i)}) \le \varepsilon; \; y^{(j)},x^{(i)} \in X \}

\end{equation*}

2. 密度

设$x \in X$，称$\rho(x) = |N_{\varepsilon}(x)|$为$x$的密度。密度是一个整数，且依赖于半径$\varepsilon$。

3. 核心点

设$x \in X$，若$\rho(x) \ge M$，则称$x$为$X$的核心点。记由$X$中所有核心点构成的集合为$X_c$，并记$X_{nc}=X-X_c$表示$X$中所有非核心点构成的集合。

4. 边界点

若$x \in X_{nc}$，且$\exists y \in X$，满足$y \in N_{\varepsilon}(x) \bigcap X_c$，即$X$的非核心点$x$的$\varepsilon$邻域中存在核心点，则称$x$ 为$X$的边界点。记由$X$中所有边界点构成的集合为$X_{bd}$。

此外，边界点也可以这么定义，若$x \in X_{nc}$，且$x$落在某个核心点的$\varepsilon$邻域内，则称$x$为$X$的边界点。一个边界点可能同时落入一个或多个核心点的$\varepsilon$ 邻域内。

5. 噪声点

记$X_{noi} = X - (X_c \bigcup X_{bd})$，若$x \in X_{noi}$，则称$x$为噪音点。

至此，我们严格给出了核心点、边界点和噪音点的数学定义，且满足$X = X_c \bigcup X_{bd} \bigcup X_{noi}$.

图1：核心点、边界点和噪声点

直观地说，核心点对应稠密区域内部的点，边界点对应稠密区域边缘的点，而噪音点对应稀疏区域中的点。

数据集通过聚类形成的子集是簇。核心点位于簇的