今天将给大家分享医学图像读取,包括dicom图像和非dicom图像,图像的存储以及修改图像信息后产生的变化结果,最后再介绍如何将SimpleITK的图像数据与Numpy的数据进行互相转换。
1、读取dicom序列文件这里采用ImageSeriesReader()来读取dicom序列图像,只需要输入dicom的目录路径就可以读取图像。
# read dicom series imagedicom_input_dir = "E:\Data\other\LIDC_nodul"print("Reading Dicom directory:", dicom_input_dir)reader = sitk.ImageSeriesReader()dicom_names = reader.GetGDCMSeriesFileNames(dicom_input_dir)reader.SetFileNames(dicom_names)image = reader.Execute()
2、读取非dicom格式文件
这里采用ReadImage()来去读非dicom格式的图像,只需要输入非dicom格式的文件名就可以读取图像。
# read imageimage = sitk.ReadImage("srcdicom.mha")
3、输出图像信息
图像除了像素信息外,还有图像大小,图像spacing信息,图像方向信息,图像原点信息。