gels imagej 图片处理_ImageJ实用技巧——3D可视化及测量(定量分析篇)

最新推荐文章于 2022-02-21 19:37:21 发布
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本文详细介绍了如何使用ImageJ进行3D图片的重构和体积测量。通过3D Viewer和Volume Viewer插件实现3D可视化，针对CT或MRI等Stack图像，调整Z轴步长以正确显示结构。接着，利用3D Object Counter测量3D体积和表面积，通过阈值设置和尺寸过滤确保精确测量。文章提供了详细的步骤和注意事项，适用于生物医学图像的定量分析。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

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在之前的文章里，对2D图片的面积测量进行了比较全面的介绍和分析：

Treasure琛：ImageJ实用技巧——面积测量综述(定量分析篇)​zhuanlan.zhihu.com
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也介绍过3D细胞的分割：

Treasure琛：ImageJ实用技巧——3D细胞自动分割(插件篇)​zhuanlan.zhihu.com
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但对于3D图片的体积测量没有深入的介绍，这篇文章会对3D体积检测以及可视化进行详细地说明。

通常我们接触到的3D图片都是2D图片叠加形成的Stack，即以一定的步长，在Z轴方向上进行层扫得出的照片，例如CT、MRI、Confocal等。

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MRI Stack

对2D图片Stack进行三维重构，可以更加清晰地看出组织的三维结构，同时也引出了一个重要的问题：怎样测量重构出的3D结构的体积（Volume）以及表面积（Surface）？

具体方法如下。

一、图片的3D可视化

通常遇到2D图片Stack，首先需要做的就是进行3D重构，以看清结构，可以使用ImageJ自带的3D可视化插件：3D Viewer（Plug

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