原标题:Graphpad Prism也可以做主成分分析(PCA)?
前段时间,Graphpad Prism 9正式发布,在我看来比较有感的更新是Prism终于可以做主成分分析(PCA)啦!当然,OmicShare课堂的Graphpad Prism系列视频教程也做了相应的更新!目前主要新增了基于Graphpad Prism 9 的主成分分析、自动添加显著性标记和气泡图绘制3节课,如下。
视频教程链接:
https://www.omicshare.com/class/home/index/series?id=45
言归正传,在之前的微信文章中已经多次介绍过PCA了,比如,、、等。下面就一起来看看如何用Prism 9 做PCA吧!
数据准备
本文所用的数据是来自R语言自带的iris(鸢尾花)数据,如下,数据导出为Excel文档的方法参考 《R如何直接读取Excel表格数据?》 一文。
如果完全不想碰R语言,其实可使用Prism自带的范例数据,方法如下。
参数设置
打开软件后,通过双击窗口灰色区域或点Prism(棱镜)的小三角,新建工程文件,在弹出的向导页面表格类型选Multiple variables(只能选这一项),Data table选enter or import data into a new table,然后点Create按钮,