lammps软件_LAMMPS分子动力学模拟技术：从入门到应用

最新推荐文章于 2024-04-28 12:12:08 发布
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文章标签： lammps软件 tracepro应用实例详解 分子动力学模拟软件 分子模拟的理论与实践

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分子动力学模拟(Molecular Dynamics)是近年来飞速发展的一种分子模拟方法，已经被广泛应用于化学化工、材料科学与工程、物理、生物医药等科学和技术领域，起到越来越重要的作用。MD模拟用来研究不能用解析方法来解决的复合体系的平衡性质和力学性质 ，用来搭建理论和实验的一个桥梁 ，在数学、生物、化学 、物理学、材料科学和计算机科学交叉学科占据重要地位。开源的分子动力学模拟软件LAMMPS具有有良好的并行扩展性，可以支持包括气态，液态或者固态相形态下、各种系综下、百万级的原子分子体系，并提供支持多种势函数，吸引越来越多的计算模拟科研人员使用。 材料人此次组织基础培训班可以为广大LAMMPS初学者提供一个良好学习平台，在较短的时间内对分子动力学理论以及LAMMPS使用的基础知识进行更有效的掌握，为今后更深一步的分子动力学模拟打下坚实的基础。 【课程安排】

直播时间：2020.12.20日至12.21日

第一天 (上午)9:00 - 12:00 分子动力学方法与理论基础详解 1. 分子动力学理论基础
1.1 常见计算模拟方法浅析：MD、DFT等
1.2 分子模拟的发展历史、分子模拟的优势和局限
1.3 分子动力学基本原理：分子运动论，分子动力学的基本假设和理论框架
1.4 分子动力学关键技术：分子动力学的主要数值算法&#
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weixin_39886841
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LAMMPS分子动力学模拟技术及应用
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LAMMPS手册。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。
【LAMMPS学习】一、LAMMPS简介
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LAMMPS 是一种经典的分子动力学 (MD) 代码，用于模拟液态、固态或气态粒子的集合。它可以使用各种原子间势（力场）和边界条件对原子、聚合物、生物、固态（金属、陶瓷、氧化物）、粒状、粗粒或宏观系统进行建模。它可以对尺寸从几个粒子到数十亿个粒子的 2d 或 3d 系统进行建模。LAMMPS 是一种经典的分子动力学 (MD) 代码，用于模拟液态、固态或气态粒子的集合。它可以使用各种原子间势（力场）和边界条件对原子、聚合物、生物、固态（金属、陶瓷、氧化物）、粒状、粗粒或宏观系统进行建模。
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lammps分子动力学模拟
01-09
很好非常好相当的好都可以下载，学习lammps分子动力学模拟的来下载吧
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mmm1098的博客
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weixin_44873868的博客
03-09 791
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以下是一些使用LAMMPS软件进行分子动力学模拟冲击波的可能的输入文件（in文件）： 1. Shock Wave Simulation with LAMMPS: ``` # Define the simulation box size variable lx equal 20.0 variable ly equal 20.0 variable lz equal 100.0 # Define the number of atoms variable natoms equal 64000 # Define the time step size variable dt equal 0.001 # Define the simulation temperature variable temp equal 300 # Define the simulation pressure variable press equal 10 # Define the output frequency variable dumpfreq equal 1000 # Define the simulation run time variable runfor equal 10000 # Define the simulation input units lj atom_style atomic dimension 3 boundary p p p read_data data.lj pair_style lj/cut 2.5 pair_coeff * * 1.0 1.0 2.5 neighbor 0.3 bin neigh_modify every 20 delay 0 check yes velocity all create ${temp} 87287 loop geom fix 1 all nve thermo 1000 thermo_style custom step temp press pe ke etotal lx ly lz timestep ${dt} # Define the shock wave fix 2 all langevin ${temp} ${temp} 100.0 904297 fix 3 all addforce 0.0 0.0 -${press} fix 4 all momentum 1 linear 1 1 1 # Define the output dump 1 all custom ${dumpfreq} dump.*.lammpstrj id type x y z dump_modify 1 sort id run ${runfor} ``` 2. Shock Wave Simulation of Graphene with LAMMPS: ``` # Define the simulation box size variable lx equal 100.0 variable ly equal 100.0 variable lz equal 10.0 # Define the number of atoms variable natoms equal 20000 # Define the time step size variable dt equal 0.001 # Define the simulation temperature variable temp equal 300 # Define the simulation pressure variable press equal 10 # Define the output frequency variable dumpfreq equal 1000 # Define the simulation run time variable runfor equal 10000 # Define the simulation input units real atom_style atomic boundary p p p read_data data.graphene pair_style airebo 3.0 1 1 pair_coeff * * CH.airebo C H neighbor 2.0 bin neigh_modify every 1 delay 0 check yes velocity all create ${temp} 87287 loop geom fix 1 all nve thermo 1000 thermo_style custom step temp press pe ke etotal lx ly lz timestep ${dt} # Define the shock wave fix 2 all langevin ${temp} ${temp} 100.0 904297 fix 3 all addforce 0.0 0.0 -${press} fix 4 all momentum 1 linear 1 1 1 # Define the output dump 1 all custom ${dumpfreq} dump.*.lammpstrj id type x y z dump_modify 1 sort id run ${runfor} ``` 以上是两个使用LAMMPS软件进行分子动力学模拟冲击波的输入文件示例，不同的模拟系统和参数可能需要使用不同的输入文件。

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