graphpad两组t检验_如何用GraphPad Prism进行两组连续变量的比较

 来源：AME科研时间

作者：胡志德

两组连续变量的比较是临床科研中经常遇见的问题，比如比较试验组和对照组的年龄是否相同。对于此类数据的分析，首先应看再试验设计上是否进行了配对，之后再看数据是否呈正态分布，方差是否齐。对于此类数据的数据，大致可以遵循图1所示的原则。

图1 两组变量变量比较的原则

可以用于两组资料比较的软件很多，比如SPSS，SAS和Stata等功能强大的专业统计软件。但笔者更倾向于用GraphPad

Prism，因为该软件操作简单，结果更容易解读。实际上，在临床科研中遇到的绝大部分统计问题，都可以通过GraphPad

Prism来解决。GrapgPad Prism是一款侧重于科学绘图的软件，但其同事具备简单的统计学功能。本文所采用GraphPad

Prism为6.0版本，其他版本的操作与此类似。该软件的安装教程在网上均可找到，在此不再赘述。本文仅简单演示如何在GraphPad

Prism进行两组连续变量的比较。

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数据的录入

打开GraphPad Prism软件后，软件会让操作者选择数据的输入类型，此时注意选择“Column”这个选项。如图2所示：

图2：数据类型的选择

之后分别输入两组变量的值。如图3所示，实验组共5个样本，检测数值分别为1，2，3，4和5；对照组也是5个样本，分别是4，5，6，7和8。也可以在表头上对数据进行标识，分别为Experiments和Controls。如果此处不进行标识，默认的组名是Dataset

A和Dataset B。

图3 在GraphPad Prism中录入结果

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结果的运算

结果录入完毕后，点击菜单栏中的Analyze，会出现如图4所示的界面。注意左侧一定要选中”t tests (and

nonparametric tests)”。

图4 选择统计方法

点击图4中的OK，会进入如图5所示界面。在此界面中，软件要求作者选择是否配对(Paired和Unpaired)，并决定选择参数检验还是非参数检验。所谓参数检验就是指配对t检验或独立样本t检验，而非参数检验则是指Mann-Whitney

U检验或配对Wilcoxon检验。如果选择参数检验(默认两组数据均呈正态分布)，软件会让操作者选择方差是否齐。

如果方差齐，软件会选择t检验，如果不齐，软件推荐Welch法。需要说明的一点是，如果两组数据均呈正太分布，但方差不齐，此时应采用校正t检验，目前有三种主要的校正t检验法：Cochran

& Cox法、Satterthwait法和Welch法。GraphPad

Prism仅支持Welch法。

如果两组数据不呈正太分布，则应该选用非参数检验。非参数的两个选项分别是Mann-Whitney

U检验和Kolmogorov-Smirnov检验。一般选择Mann-Whitney U检验。

图5

选择统计方法

除了Experimental

Design以外，还可以对Optional选项里面的内容进行修改。如图6所示。一般建议选择“Discreptive

statistics for each data set”(展示各组数据的均数、中位数、标准差、秩和等)选项。在P

value一段，系统默认为双尾检验，一般建议不要更改。

图6 统计选项

所有的选项选择完毕后，点击OK即可进行计算。

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结果的解读

结果一般分为两个部分，一是差异是否具有统计学意义；二是差异有多大。如果研究者选择了Mann-Whitney

U检验，则可得到如图7所示的结果。

图7 非参数分析结果的解读

参数分析结果的解读与此类似，只不过多了个F test to compare

variances，即方差是否齐。一般认为，P值大于0.10才可以认为两组数据方差相同(注意：是“大于”，不是“小于”！是“0.10”，不是“0.05”！！！！)。

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检验数据是否呈正态分布

可能有的读者会问GraphPad

Prism能否判断数据是否呈正态分布。其实是可以进行正态分布检验的。以上述两组数据为例，首先点击Analyze，然后选择XY

Analysis下面的Column statistics。如图8所示：

图8 进行正态分布检验

如图9所示，GraphPad

Prism提供了三种检验数据是否呈正态分布的方法：D’Agootino-Pearson法，Kolmogorov-Smirnov法和Shapiro-Wilk法。针对同一种数据，三种方法的计算结果大同小异。虽然GraphPad

Prism不推荐用Kolmogorov-Smirnov法，但根据笔者经验，在国际上发表论文时，多采用Kolmogorov-Smirnov法的结果，可能是因为当样本量太小时，Shapiro-Wilk法和D’Agootino-Pearson法无法给出检验结果。当然，也可以三种方法都选择，综合判断数据是否呈正态分布。

图9 进行正态分布检验(第二步)

选择好统计方法之后点击OK，就可以得到正态检验的结果，如图10所示。需要特别说明的是：在正态检验中，一般认为P大于0.10才表述数据呈正态分布(注意：是“大于”，不是“小于”！是0.10，不是“0.05”！！！！)。在本案例中，两组数据的P值均为0.20，因此可以认为两组数据均呈正态分布。

图10 Kolmogorov-Smirnov法结果的解读

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结语

综上，本文讨论了两组连续变量比较的原则，并就如何在GraphPad

Prism中进行两组变量的比较，以及如何进行正态检验进行了演示。实际上，很多软件都可以进行上述操作，只是笔者认为GraphPad

Prism的操作最为简单，结果也容易解读。通常情况下，我们在临床医学科研中遇到的统计学问题并不是十分复杂，使用GraphPad

Prism基本可以满足作者的要求。在国际杂志上发表论文时，很多作者也在文中说明自己的所用的统计学软件为GraphPad

Prism，审稿人并不会因为GraphPad

Prism较为简洁而认为统计结果不可靠。其实不管是什么统计软件，能解决科研中遇到的统计学问题才是关键。