作图的目的是希望在图里面发现问题或者解释问题,当然更本质一点就是你想解决什么问题?
前几天做了一个PCA的图,图是画出来了,但是问题有很多,比如说主成分是是啥意思,图里面的箭头有什么含义?为了不做无意义的重复,所以写一篇文章尝试做一个解释。
我们以R语言自带的数据集iris作为例子来演示。
data(iris)
iris翻译成中文就是鸢(yuan, 第一声)尾花(如下图), 我建议你在R语言里用?iris了解更多这个数据集的出处。
iris
先让我们用head简单看下这个数据集的前面几行。其中前面四列是一朵鸢尾花的一些形态特征衡量值,自行翻译各个单词的含义。最后一列是这朵花的所属物种,根据分类,这些花来自于"setosa, versicolor,virginica"
> head(iris)
Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
1 5.1 3.5 1.4 0.2 setosa
2 4.9 3.0 1.4 0.2 setosa
3 4.7 3.2 1.3 0.2 setosa
4 4.6 3.1 1.5 0.2 setosa
5 5.0 3.6 1.4 0.2 setosa
6 5.4 3.9 1.7 0.4 setosa
在平常人眼里, 看到这些数值可能没有任何想法,也不知道这到底是什么品种,但是对于一个研究鸢尾花的人,这些数值可能会在他们的脑海里重构出一朵鸢尾花,然后迅速判断出这是什么品种。我和阅读文章的人都一样