linux下gsl怎么运行,linux下GSL安装

背景：

Blei的hlda的C语言实现需要使用C语言的科学计算包GSL，因此决定安装。由于在windows下安装极其繁琐，先在Linux上安装之。

系统环境：

Linux version 2.6.35-22-generic (buildd@allspice)

(gcc version 4.4.5 (Ubuntu/Linaro 4.4.4-14ubuntu4) )

#33-Ubuntu SMP Sun Sep 19 20:32:27 UTC 2010

gsl安装过程

1, 下载 gsl-1.9.tar.gz

2, 安装

tar -zxvf gsl-1.9.tar.gz

cd gsl-1.9

sudo ./configure

sudo make

sudo make install

执行最后一个命令之后会有很多现实，其中有：

Libraries have been installed in:

/usr/local/lib

If you ever happen to want to link against installed libraries

in a given directory, LIBDIR, you must either use libtool, and

specify the full pathname of the library, or use the `-LLIBDIR'

flag during linking and do at least one of the following:

- add LIBDIR to the `LD_LIBRARY_PATH' environment variable

during execution

- add LIBDIR to the `LD_RUN_PATH' environment variable

during linking

- use the `-Wl,--rpath -Wl,LIBDIR' linker flag

- have your system administrator add LIBDIR to `/etc/ld.so.conf'

See any operating system documentation about shared libraries for

more information, such as the ld(1) and ld.so(8) manual pages.

一个是libgslcblas.so，libgsl.so的位置很重要，编译后的文件被扔到了这里，比如 /usr/local/lib；另一个重要的位置是

gsl_rng.h 这样的头文件所在的文件夹目录，比如/usr/local/include/gsl。如果想要查找他们，可以使用find / -name gsl_rng.h这样的命令。

3，使用gsl

用gsl写一个例子文件gsl_test.c，这个文件来源于http://www.mas.ncl.ac.uk/~ndjw1/teaching/sim/gsl.html

#include 

#include 

#include 

int main (int argc, char *argv[])

{

/* set up GSL RNG */

gsl_rng *r = gsl_rng_alloc(gsl_rng_mt19937);

/* end of GSL setup */

int i,n;

double gauss,gamma;

n=atoi(argv[1]);

for (i=0;i

{

gauss=gsl_ran_gaussian(r,2.0);

gamma=gsl_ran_gamma(r,2.0,3.0);

printf("%2.4f %2.4f\n", gauss,gamma);

}

return(0);

}(1)第一反应是直接 gcc gsl_test.c

显示错误是：gsl_test.c:2: fatal error: gsl_rng.h: 没有那个文件或目录

(2)这个错误是说没有找到头文件，然后加上头文件的位置，gcc -I/usr/local/include/gsl gsl_test.c

显示错误是：gsl_test.c:(.text+0x12): undefined reference to `gsl_rng_mt19937' ...

(3)这个错误是说没有找到gsl_rng_mt19937的定义，查看了http://www.daniweb.com/software-development/cpp/threads/289812/cant-link-gsl-properly，这里说需要加上-lgsl，即链接到gsl，找到 libgsl.so.

使用命令：gcc -I/usr/local/include/gsl -lgsl gsl_test.c

(4)显示错误是：//usr/local/lib/libgsl.so: undefined reference to `cblas_ctrmv'

查看了http://sourceware.org/ml/gsl-discuss/2003-q2/msg00123.html，是说错误是由于没有链接libgslcblas.so引起的，再加上-lgslcblas可以解决问题。

使用命令：gcc -I/usr/local/include/gsl -lgsl -lgslcblas gsl_test.c。

或者命令：gcc -I/usr/local/include/gsl -L/usr/local/lib -lgsl -lgslcblas gsl_test.c

这个时候出现了产出物a.out。

(5)运行a.out

./a.out 出现错误“段错误”

(6)查看源文件，发现还需要输入参数

./a.out 10

结果是：

0.2678 6.9645

3.3488 1.6894

1.9950 2.1575

-4.7934 6.1648

-0.0782 4.0292

1.7871 11.6031

-2.5931 7.7629

0.3634 1.3344

-1.0965 11.1658

0.0142 3.5412

彻底搞定，done#