winscp远程访问服务器运行代码没有图片_使用远程计算服务器计算Gaussian任务手册...

提交计算前需要准备的文件和软件：

1 后缀名为.gjf的Gaussian输入文件。

2 后缀名为.sh的脚本文件。

2 用于本地计算机与远程计算服务器链接、通信和文件交换的WinSCP软件。

2 远程计算服务器的账户密码。

一、运行WinSCP.exe文件

弹出Login对话框，在Host name 中填写202.121.122.192，Port Number保持默认。User name和Password中填写自己的账户和密码。

点击下方的Login，完成登录，如下图所示。

二、 提交计算

2.1 点击如下图红圈处的PuTTY，或者直接按ctrl+p运行。

    当出现如下界面说明启动成功。

2.2 检查计算服务器状态

   检查计算服务器状态的常见命令。

    如何运行命令：输入对应的命令，按enter回车。

        top- 查看当前服务器的运行状态。如果下图中圈红圈处不为0，10几20几甚至30到50之间的数字说明有其他人在执行计算任务。

        ctrl+c：退出查看当前服务器的运行状态界面。

        qstat：查看自己提交的任务状态。运行后出现如下界面。Job ID为任务。红圈处为R代表任务正在进行中。c代表任务已经取消或完成。Q代表此任务正在排队中。需要指出的是，状态C，可能是任务输入文件.gjf文件有问题，计算任务没有开始就结束了，需要仔细检查输入文件。可能是刚刚计算完成，状态也可能是C。也可能是任务被其他原因终止。

2.3 提交任务

2.3.1 新建此次任务的文件夹，注意做好分类管理。以便自己日后查询、下载。

2.3.2 在WinSCP的图形界面中上传准备好的.gjf文件和.sh文件。

2.3.3 修改.sh脚本文件。

打开.sh文件，内容如下图所示。

第一个红圈处的XXX为自己准备好的gjf文件的名字。

第二个红圈处XXX为自己准备好的gjf文件的名字。后面的.gjf不能删掉。其他内容保持不变。保存、关闭。

2.3.4 切换到此次任务的目录(如有必要)。

    使用命令cd xxx/xxx/xxx/ 命令切换到此次任务的目录。效果如下图所示。下图中的dfive为本案例中的示例文件夹名，可以自己任意指定。

2.3.5 使用qsub xxx.sh命令提交计算任务。也可以用qstat查看自己的任务状态。等待计算完成，取决于分子的大小，计算花费预计从几分钟到几天不等。

2.3.6 转换计算结果并下载。

在2.3.1中所建立的文件夹中可以看到计算完成的xxx.chk文件。需要在命令行中使用formchk xxx.chk xxx.fchk，转换生成.fchk文件。出现如下文字代表转换成功。不执行此命令直接下载xxx.chk文件到自己的电脑上无法打开。

选中xxx.fchk文件，使用Download下载到自己的电脑上。