matlab nii格式,.img/.hdr格式转.nii格式的操作

%%img2nii.m--------------------------------------------

%Script to convert hdr/img files to nii.

%This script uses SPM function, so you need to install SPM5 or later.

%Kiyotaka Nemoto 05-Nov-2014

%select files

f = spm_select(Inf,'img$','Select img files to be converted');

%convert img files to nii

for i=1:size(f,1)

input = deblank(f(i,:));

[pathstr,fname,ext] = fileparts(input);

output = strcat(fname,'.nii');

V=spm_vol(input);

ima=spm_read_vols(V);

V.fname=output;

spm_write_vol(V,ima);

end

附加一下volume data是如何转surface data的吧…

wb_command -volume-to-surface-mapping ArticParcels_Smithetal.nii /home/murphyhuang/tmp/nii/HCP_fMRI/Q1-Q6_R440.L.flat.32k_fs_LR.surf.gii outL.shape.gii -trilinear

补充知识：数据读取——(.img .hdr)

1、定义

该图像格式含有两部分：一个是图像 ‘.img '，另一个是图像头文件 '.hdr'，该文件记录了图像的信息，如图像尺寸、波段数、数据类型和大小端等。如果缺少头文件，将无法对图像进行读取，因此头文件十分重要。

2、读取

使用Matlab中NifTi包读取。

eg：

img=load_nii(‘D:\a01_101_bmask.hdr')

以上这篇.img/.hdr格式转.nii格式的操作就是小编分享给大家的全部内容了，希望能给大家一个参考，也希望大家多多支持脚本之家。