python2 mutiprocessing 安装_Linux软件安装|Amber20

假设你已经有了Amber20的源代码，文件夹名叫amber20_src，并且现在在amber20_src这个目录里面。

安装串行版本的Amber

进入build文件夹内，执行run_cmake脚本，然后make install：

cd build/
./run_cmake
make install -j8
cd ..

之后，Amber20便已安装在../amber20内，执行以下命令激活它：

source ../amber20/amber.sh

安装并行版本的Amber

安装并行版本前，请先安装串行版本。

先下载并安装mpich，执行AmberTools/sec/configure_mpich g后mpich将自动安装：

cd AmberTools/src/
wget http://www.mpich.org/static/downloads/3.3.2/mpich-3.3.2.tar.gz
tar vxzf mpich-3.3.2.tar.gz
./configure_mpich gnu
cd ../../build

安装好mpich后，我们修改build文件夹下的run_cmake文件，将-DMPI=FALSE改为-DMPI=TRUE。用diff表示就是：

diff --git a/build/run_cmake b/build/run_cmake
index 08406b017f..b3e2419f56 100755--- a/build/run_cmake+++ b/build/run_cmake@@ -39,7 +39,7 @@ else   cmake $AMBER_PREFIX/amber20_src \
     -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$AMBER_PREFIX/amber20 \
     -DCOMPILER=GNU  \
-    -DMPI=FALSE -DCUDA=FALSE -DINSTALL_TESTS=TRUE \+    -DMPI=TRUE -DCUDA=FALSE -DINSTALL_TESTS=TRUE \     -DDOWNLOAD_MINICONDA=TRUE -DMINICONDA_USE_PY3=TRUE \
     2>&1 | tee  cmake.log

之后重复串行的安装操作，执行run_cmake，并make install，即可：

./run_cmake
make install -j8
cd ..

并行版本的Amber同样安装在../amber20文件夹内。

参考文献：

Amber 2020 Reference Manual，http://ambermd.org/doc12/Amber20.pdf