决策树算法_决策树算法实战篇

上篇文章介绍了决策树算法的理论篇,本节来介绍如何用决策树解决实际问题。

决策树是常用的机器学习算法之一,决策树模型的决策过程非常类似人类做判断的过程,比较好理解。

决策树可用于很多场景,比如金融风险评估,房屋价格评估,医疗辅助诊断等。

要使用决策树算法,我们先来介绍一下 scikit-learn

1,scikit-learn

scikit-learn 是基于Python 的一个机器学习库,简称为sklearn,其中实现了很多机器学习算法。我们可以通过sklearn 官方手册来学习如何使用它。

[scikit-learn](https://scikit-learn.org/stable/)

[sklearn 官方手册](https://scikit-learn.org/stable/user_guide.html) 

sklearn 自带数据集

要进行数据挖掘,首先得有数据。sklearn 库的datasets 模块中自带了一些数据集,可以方便我们使用。

[datasets](https://github.com/scikit-learn/scikit-learn/tree/master/sklearn/datasets/data)

sklearn 自带数据集:

  1. 鸢尾花数据集:load_iris()

  2. 乳腺癌数据集:load_breast_cancer()

  3. 手写数字数据集:load_digits()

  4. 糖尿病数据集:load_diabetes()

  5. 波士顿房价数据集:load_boston()

  6. 体能训练数据集:load_linnerud()

  7. 葡萄酒产地数据集:load_wine()

冒号后边是每个数据集对应的函数,可以使用相应的函数来导入数据。

比如我们用如下代码导入鸢尾花数据集

from sklearn.datasets import load_irisiris = load_iris()

使用dir(iris) 查看iris 中包含哪些属性:

>>> dir(iris)['DESCR', 'data', 'feature_names', 'filename', 'frame', 'target', 'target_names']

2,sklearn 中的决策树

sklearn 库的tree 模块实现了两种决策树:

  • sklearn.tree.DecisionTreeClassifier 类:分类树的实现。

  • sklearn.tree.DecisionTreeRegressor 类:回归树的实现。

分类树用于预测离散型数值,回归树用于预测连续性数值。

sklearn 只实现了预剪枝,没有实现后剪枝

DecisionTreeClassifier 类的构造函数

def __init__(self, *,       criterion="gini",       splitter="best",       max_depth=None,       min_samples_split=2,       min_samples_leaf=1,       min_weight_fraction_leaf=0.,       max_features=None,       random_state=None,       max_leaf_nodes=None,       min_impurity_decrease=0.,       min_impurity_split=None,       class_weight=None,       ccp_alpha=0.0):

DecisionTreeClassifier 类的构造函数中的criterion 参数有2 个取值:

  • entropy:表示使用 ID3 算法(信息增益)构造决策树。

  • gini:表示使用CART 算法(基尼系数)构造决策树,为默认值。

其它参数可使用默认值。

sklearn 库中的决策分类树只实现了ID3 算法和CART 算法。

DecisionTreeRegressor 类的构造函数

def __init__(self, *,      criterion="mse",      splitter="best",      max_depth=None,      min_samples_split=2,      min_samples_leaf=1,      min_weight_fraction_leaf=0.,      max_features=None,      random_state=None,      max_leaf_nodes=None,      min_impurity_decrease=0.,      min_impurity_split=None,      ccp_alpha=0.0):

DecisionTreeRegressor 类的构造函数中的criterion 参数有4 个取值:

  • mse:表示均方误差算法,为默认值。

  • friedman_mse:表示费尔德曼均方误差算法。

  • mae:表示平均误差算法。

  • poisson:表示泊松偏差算法。

其它参数可使用默认值。

3,构造分类树

我们使用 sklearn.datasets 模块中自带的鸢尾花数据集 构造一颗决策树。

9c5087d9462c09983b7efe16fd67e0fc.png

3.1,鸢尾花数据集

鸢尾花数据集目的是通过花瓣的长度和宽度,及花萼的长度和宽度,预测出花的品种。

这个数据集包含150条数据,将鸢尾花分成了三类(每类是50条数据),分别是:

  • setosa,用数字 0 表示。

  • versicolor,用数字 1 表示。

  • virginica,用数字 2 表示。

我们抽出3 条数据如下:

5.1,3.5,1.4,0.2,06.9,3.1,4.9,1.5,15.9,3.0,5.1,1.8,2

数据的含义:

  • 每条数据包含5 列,列与列之间用逗号隔开。

  • 从第1 列到第5 列,每列代表的含义是:花萼长度花萼宽度花瓣长度花瓣宽度花的品种

  • 在机器学习中,前4列称为特征值,最后1列称为目标值。我们的目的就是用特征值预测出目标值。

将上面3 条数据,用表格表示就是:

花萼长度花萼宽度花瓣长度花瓣宽度花的品种
5.13.51.40.20
6.93.14.91.51
5.93.05.11.82

3.2,构造分类树

首先导入必要的类和函数:

from sklearn.tree import DecisionTreeClassifierfrom sklearn.datasets import load_irisfrom sklearn.model_selection import train_test_splitfrom sklearn.metrics import accuracy_score

其中:

  • DecisionTreeClassifier 类用于构造决策树。

  • load_iris() 函数用于导入数据。

  • train_test_split() 函数用于将数据集拆分成训练集与测试集。

  • accuracy_score() 函数用于为模型的准确度进行评分。

导入数据集:

iris = load_iris()    # 准备数据集features = iris.data  # 获取特征集labels = iris.target  # 获取目标集

将数据分成训练集测试集,训练集用于训练模型,测试集用于测试模型的准确度。

train_features, test_features, train_labels, test_labels =   train_test_split(features, labels, test_size=0.33, random_state=0)

我们向train_test_split() 函数中传递了4 个参数,分别是:

  • features:特征集。

  • labels:目标集。

  • test_size=0.33:测试集数据所占百分比,剩下的数据分给训练集。

  • random_state=0:随机数种子。

该函数返回4 个值,分别是:

  • train_features:训练特征集。

  • test_features:测试特征集。

  • train_labels:训练目标集。

  • test_labels:测试目标集。

接下来构造决策树:

# 用 CART 算法构建分类树(你也可以使用 ID3 算法构建)clf = DecisionTreeClassifier(criterion='gini')# 用训练集拟合构造 CART分类树clf = clf.fit(train_features, train_labels)

上面两句代码已经在注释中说明,最终我们得到了决策树clf(classifier 的缩写)。

clf 预测测试集数据,test_predict 为预测结果:

test_predict = clf.predict(test_features)

计算预测结果的准确率:

score = accuracy_score(test_labels, test_predict)score2 = clf.score(test_features, test_labels)print(score, score2)

最终得出,sorce 和 score2 都为 0.96,意思就是我们训练出的模型的准确率为96%

函数 accuracy_score() 和 clf.score() 都可以计算模型的准确率,但注意这两个函数的参数不同。

4,打印决策树

为了清楚的知道,我们构造出的这个决策树 cfl 到底是什么样子,可使用 graphviz 模块将决策树画出来。

代码如下:

from sklearn.tree import export_graphvizimport graphviz# clf 为决策树对象dot_data = export_graphviz(clf)graph = graphviz.Source(dot_data)# 生成 Source.gv.pdf 文件,并打开graph.view()

为了画出决策树,除了需要安装相应的 Python 模块外,还需要安装Graphviz软件。

[Graphviz](http://www.graphviz.org/download/)

由上面的代码,我们得到的决策树图如下:

97b6971bfbd29c7b816b95046f853ddd.png

我们以根节点为例,来解释一下每个方框里的四行数据(叶子节点是三行数据)都是什么意思。

f034558aadb7326fd3a2bac70a5d5bb0.png

四行数据所代表的含义:

  • 第一行X[3]<=0.75:鸢尾花数据集的特征集有4 个属性,所以对于X[n]中的n的取值范围为0<=n<=3X[0] 表示第1个属性,X[3] 表示第4 个属性。X[3]<=0.75 的意思就是当X[3] 属性的值小于等于0.75 的时候,走左子树,否则走右子树。

    • X[0] 表示花萼长度。

    • X[1] 表示花萼宽度。

    • X[2] 表示花瓣长度。

    • X[3] 表示花瓣宽度。

  • 第二行gini=0.666,表示当前的gini 系数值。

  • 第三行samples=100samples 表示当前的样本数。

    • 我们知道整个数据集有150 条数据,我们选择了0.33 百分比作为测试集,那么训练集的数据就占0.67,也就是100 条数据。

    • 根节点包含所有样本集,所以根节点的 samples 值为100。

  • 第四行valuevalue 表示属于该节点的每个类别的样本个数,value 是一个数组,数组中的元素之和为samples 值。我们知道该数据集的目标集中共有3 个类别,分别为:setosaversicolor 和 virginica。所以:

    • value[0] 表示该节点中setosa 种类的数据量,即34。

    • value[1] 表示该节点中versicolor 种类的数据量,即31。

    • value[2] 表示该节点中virginica 种类的数据量,即35。

4.1,打印特征重要性

我们构造出来的决策树对象 clf 中,有一个feature_importances_ 属性,如下:

>>> clf.feature_importances_array([0, 0.02252929, 0.88894654, 0.08852417])

clf.feature_importances_ 是一个数组类型,里边的元素分别代表对应特征的重要性,所有元素之和为 1。元素的值越大,则对应的特征越重要。

所以,从这个数组,我们可以知道,四个特征的重要性排序为:

  • 花瓣长度 > 花瓣宽度 > 花萼宽度 > 花萼长度

我们可以使用下面这个函数,将该数组画成柱状图:

import matplotlib.pyplot as pltimport numpy as np# mode 是我们训练出的模型,即决策树对象# data 是原始数据集def plot_feature_importances(model, data):    n_features = data.data.shape[1]    plt.barh(range(n_features), model.feature_importances_, align='center')    plt.yticks(np.arange(n_features), data.feature_names)    plt.xlabel("Feature importance")    plt.ylabel("Feature")    plt.show()plot_feature_importances(clf, iris)

下图是用 plot_feature_importances() 函数生成的柱状图(红字是我添加的),从图中可以清楚的看出每个特种的重要性。

28997a21913bb0bdbe7e7bbf5d9bbe17.png

从该图中也可以看出,为什么决策树的根节点的特征是 X[3]

5,构造回归树

我们已经用鸢尾花数据集构造了一棵分类树,下面我们用波士顿房价数据集构造一颗回归树。

[波士顿房价数据集](https://github.com/scikit-learn/scikit-learn/blob/master/sklearn/datasets/data/boston_house_prices.csv)

来看几条数据:

bb9355c277d9ecb496860fc7c194550e.png

首先,我们认为房价是有很多因素影响的,在这个数据集中,影响房价的因素有13 个:

  1. "CRIM",人均犯罪率。

  2. "ZN",住宅用地占比。

  3. "INDUS",非商业用地占比。

  4. "CHAS",查尔斯河虚拟变量,用于回归分析。

  5. "NOX",环保指数。

  6. "RM",每个住宅的房间数。

  7. "AGE",1940 年之前建成的房屋比例。

  8. "DIS",距离五个波士顿就业中心的加权距离。

  9. "RAD",距离高速公路的便利指数。

  10. "TAX",每一万美元的不动产税率。

  11. "PTRATIO",城镇中教师学生比例。

  12. "B",城镇中黑人比例,

  13. "LSTAT",地区有多少百分比的房东属于是低收入阶层。

数据中的最后一列的数据是房价:

  • "MEDV" ,自住房屋房价的中位数。

因为房价是一个连续值,而不是离散值,所以需要构建一棵回归树

下面对数据进行建模,构造回归树使用 DecisionTreeRegressor 类:

from sklearn.tree import DecisionTreeRegressorfrom sklearn.datasets import load_bostonfrom sklearn.model_selection import train_test_splitfrom sklearn.metrics import r2_score, mean_absolute_error, mean_squared_error# 准备数据集boston = load_boston()# 获取特征集和房价features = boston.dataprices = boston.target# 随机抽取33% 的数据作为测试集,其余为训练集train_features, test_features, train_price, test_price =    train_test_split(features, prices, test_size=0.33)# 创建CART回归树dtr = DecisionTreeRegressor()# 拟合构造 CART回归树dtr.fit(train_features, train_price)# 预测测试集中的房价predict_price = dtr.predict(test_features)# 测试集的结果评价print('回归树准确率:', dtr.score(test_features, test_price)) print('回归树r2_score:', r2_score(test_price, predict_price)) print('回归树二乘偏差均值:', mean_squared_error(test_price, predict_price))print('回归树绝对值偏差均值:', mean_absolute_error(test_price, predict_price)) 

最后四行代码是计算模型的准确度,这里用了4 种方法,输出如下:

回归树准确率: 0.7030833400349499回归树r2_score: 0.7030833400349499回归树二乘偏差均值: 28.40730538922156回归树绝对值偏差均值: 3.6275449101796404

需要注意,回归树与分类树预测准确度的方法不一样:

  • dtr.score():与分类树类似,不多说。

  • r2_score():表示R 方误差,结果与 dtr.score() 一样,取值范围是0 到1。

  • mean_squared_error():表示均方误差,数值越小,代表准确度越高。

  • mean_absolute_error():表示平均绝对误差,数值越小,代表准确度越高。

可以用下面代码,将构建好的决策树画成图:

from sklearn.tree import export_graphvizimport graphviz# dtr 为决策树对象dot_data = export_graphviz(dtr)graph = graphviz.Source(dot_data)# 生成 Source.gv.pdf 文件,并打开graph.view()

这棵二叉树比较大,你可以自己生成看一下。

再来执行下面代码,看下特征重要性:

import matplotlib.pyplot as pltimport numpy as np# mode 是我们训练出的模型,即决策树对象# data 是原始数据集def plot_feature_importances(model, data):    n_features = data.data.shape[1]    plt.barh(range(n_features), model.feature_importances_, align='center')    plt.yticks(np.arange(n_features), data.feature_names)    plt.xlabel("Feature importance")    plt.ylabel("Feature")    plt.show()plot_feature_importances(dtr, boston)

从生成的柱状图,可以看到 LSTAT 对房价的影响最大:

e4fb9b44d0c1b2ca778175db5804c361.png

6,关于数据准备

本文中用到的数据是sklearn 中自带的数据,数据完整性比较好,所以我们没有对数据进行预处理。实际项目中,可能数据比较杂乱,所以在构建模型之前,先要对数据进行预处理。

  1. 要对数据有个清楚的认识,每个特征的含义。如果有特别明显的特征对我们要预测的目标集没有影响,则要将这些数据从训练集中删除。

  2. 如果某些特征有数据缺失,需要对数据进行补全,可以使用著名的 Pandas 模块对数据进行预处理。如果某特征的数据缺失严重,则应该将其从训练集中删除。对于需要补全的值:

    1. 如果缺失的值是离散型数据,可以用出现次数最多的值去补全缺失值。

    2. 如果缺失的值是连续型数据,可以用该特征的平均值去补全缺失值。

  3. 如果某些特征的值是字符串类型数据,则需要将这些数据转为数值型数据。

    1. 可以使用 sklearn.feature_extraction 模块中的 DictVectorizer 类来处理(转换成数字 0/1)。

  4. 在测试模型的准确率时,如果测试集中只有特征值没有目标值,就不好对测试结果进行验证。此时有两种方法来测试模型准确率:

    1. 在构造模型之前,用 train_test_split() 函数将原始数据集(含有目标集)拆分成训练集和测试集。

    2. 使用 sklearn.model_selection 模块中的 cross_val_score 函数进行K 折交叉验证来计算准确率。

K 折交叉验证原理很简单: 

1. 将数据集平均分成K 个等份,K 一般取10。 

2. 使用K 份中的1 份作为测试数据,其余为训练数据,然后进行准确率计算。 

3. 进行多次以上步骤,求平均值。

7,总结

本篇文章介绍了如何用决策树来处理实际问题。主要介绍了以下知识点:

  • sklearn 是基于 Python 的一个机器学习库。

  • sklearn.datasets 模块中有一些自带数据集供我们使用。

  • sklearn.tree 中的两个类来构建分类树和回归树:

    • DecisionTreeClassifier 类:构造决策分类树,用于预测离散值。

    • DecisionTreeRegressor 类:构造决策回归树,用于预测连续值。

  • 分别介绍了两个类的构造函数中的 criterion 参数的含义。

  • 介绍了几个重要函数的用途:

    • train_test_split() 函数用于拆分数据集。

    • o.fit() 用于拟合决策树。(o 表示决策树对象)

    • o.predict() 用于预测数据。

    • o.score() 用于给模型的准确度评分。

    • accuracy_score() 函数用于给分类树模型评分。

    • r2_score() 函数用于给回归树模型评分。

    • mean_squared_error() 函数用于给回归树模型评分。

    • mean_absolute_error() 函数用于给回归树模型评分。

  • 介绍了如何给决策树画图。

  • 介绍了如何给特征重要性画图。

(本节完。)


推荐阅读:

决策树算法-理论篇


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