重定义 不同的基类型_第一性原理计算建模教程(二):QE中的结构定义

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目录:

第一节:晶体结构要点

第二节:QE中的结构定义

第三节:晶胞和原胞的相互转换

第四节:分数坐标和直角坐标的相互转换

非周期性系统

平板(slab)模型的建立

注释

References

QE输入文件的总体结构如下图,输入文件的前半部分满足Fortran语言的Namelist语法。与结构有关的包括SYSTEM部分的ibrav,celldm,nat,ntyp以及ATOMIC_POSITIONS和CELL_PARAMETERS共三个部分。

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QE计算的结构都是在三维空间中周期性重复的,所以需要定义周期性的单元(这里称作CELL,单元),以及周期性单元内的原子坐标。在QE中用三个矢量

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定义CELL。CELL的定义本身不依赖于空间直角坐标系(笛卡尔坐标系)的选择,只需要定义三个基矢量的长度和三个夹角,但是为了计算,需要确定一个空间直角坐标系,以写出各个矢量的笛卡尔坐标,

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这里空间直角坐标系的选取,对于ibrav≠0是在QE程序内部进行的,用户不需要设置;对于ibrav=0是用户通过写出CELL_PARAMETERS而确定的。

设置ibrav=0,这时需要在输入文件中写入CELL_PARAMETERS,即CELL的基矢量&#x

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