weixin_40439607的博客

原创 利用snakemake + singularity搭建生信分析流程

本文是作者学习笔记。snakemake作为一款主流流程管理软件，对比shell，py，R写的流程它的好处是不言而喻的。基本操作和技巧可以参考官方文档和各种博客上的文章，这里主要介绍如何利用singularity容器配合snakemake。我们搭建生信流程的时候最麻烦的事是什么？那我相信很多同学的答案都会是：装软件。装软件这个活它主要麻烦在于我们的环境是各不相同的（包括操作系统，编译软件，语...