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原创 R语言计算相关系数时出现NA的原因

R中公式 cor(x,y) = cov(x,y)/(sd(x)*sd(y))相关性系数R=协方差/两个变量标准差的乘积。In cor(x, y) : 标准差为零。

2023-05-29 07:55:43 2868 1

原创 R语言报错Error in grid.Call(C_convert, x, as.integer(whatfrom), as.integer(whatto), : Viewport has z

报错原因:1.画板没有拉大,拉大可解决。2.输出pdf的宽和高设置太小,如下都是1时报错,改大可解决。pdf(file = file.path(path,“1.1Proteins counts of all samples.pdf”),width=1, height=1)你好! 这是你第一次使用 Markdown编辑器 所展示的欢迎页。如果你想学习如何使用Markdown编辑器, 可以仔细阅读这篇文章,了解一下Markdown的基本语法知识。我们对Markdown编辑器进行了一些功能拓展与语法支持,

2023-05-20 15:12:11 2690 1

原创 R语言,去除向量中数值为0的元素

R语言,去除向量中数值为0的元素

2022-08-18 17:35:29 2716

原创 安装Bioconductor包和加载DESeq2包的报错问题解决

旧方法(现在不能用)#错误1: Error in file(filename, “r”, encoding = encoding) : cannot open the connection In addition: Warning message: In file(filename, “r”, encoding = encoding) : InternetOpenUrl failed: ‘操作超时’。#解决1: 换镜像/网速问题。#错误2: With R version 3.5 or greater.

2020-10-28 09:55:10 12672 1

原创 如何用R语言中ggplot包在同一张图上画两组折线图,或者散点图

library(‘ggplot2’)getwd()workdir=“C:/Users/lyqro/Desktop”file=“C:/Users/lyqro/Desktop/final_data.csv”setwd(workdir)dat=read.table(file,sep=",",check.names=F,header=T)head(dat,10)

2020-06-22 23:39:07 36244 5

原创 blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx的区别与用法

blastn:是将给定的核酸序列与核酸数据库中的序列进行比较;Blastp:是使用蛋白质序列与蛋白质数据库中的序列进行比较,可以寻找较远的关系;Blastx:将给定的核酸序列按照六种阅读框架将其翻译成蛋白质与蛋白质数据库中的序列进行比对,对分析新序列和EST很有用;Tblastn:将给定的氨基酸序列与核酸数据库中的序列(双链)按不同的阅读框进行比对,对于寻找数据库中序列没有标注的新编码区很有...

2019-09-12 11:20:52 83278

原创 R或Rstudio中突然不能成功加载(library)ggplot包或其他包,不存在叫colorspace的这个包,如何解决?

install.packages(“ggplot2”,repos=“http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/”)trying URL ‘http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin/windows/contrib/3.5/ggplot2_3.2.1.zip’Content type ‘application...

2019-08-28 22:36:08 26524 5

空空如也

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