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目前,机器学习已广泛地应用于脑科学领域的研究中,特别是在利用脑影像数据进行疾病的诊断方面,离不开分类算法。支持向量机(Support Vector Machine, SVM)作为一种有监督学习的二元分类器,在小样本分类中具有突出的优势,因此非常适合于基于脑影像数据的疾病分类研究。LIBSVM工具包是台湾大学Lin Chih-Jen教授等开发一个SVM工具包,其可运行于Python, R, MATLAB等语言环境下,是目前大家用的比较多的一个SVM工具包。本文,笔者详细阐述Matlab环境下LIBSVM的安装和使用教程,希望对大家的研究有所帮助。
LIBSVM的安装
- 直接打开LIBSVM的官方网址进行下载:
https://www.csie.ntu.edu.tw/~cjlin/libsvm/#matlab
从图1可以看到,LIBSVM可以在多种语言环境下都可以运行。
从打开的网页中找到图2所示的下载页面,点击下载zip或 tar.gz格式的压缩包,目前的最新版本是libsvm-3.23
图1
图2
-
解压下载的压缩文件,里面包含包含MATLAB、Python等版本的安装包,这里笔者仅介绍Matlab环境下LIBSVM的安装,如图3所示:
图3 -
把解压出来的libsvm-3.23文件夹复制到你想存储的位置,这里笔者把libsvm-3.23文件夹放置在了“D:/tool”文件夹里面。
接下来,进行Matlab设置路径:Matlab菜单选择“File—Set Path—Add with Subfolders”,选中libsvm-3.23文件夹,最后点击Save,如图4所示:
图4
-
把Matlab当前路径设置到libsvm-3.23的matlab文件夹,即D:\tool\libsvm-3.23\matlab,如图5所示:
图5 -
配置Matlab编译器。在Matlab命令窗口中输入“mex -setup”指令,会提示你选择Matlab默认的编译器。这里,笔者电脑中只装了一个编译器,即Microsoft Visual C++ 2010,故选择这个编译器即可,如图6所示。
注意:如果你电脑中未安装,会提示错误。这时你可以打开如下网址安装不同Matlab版本兼容的编译器。
https://www.mathworks.com/support/requirements/previous-releases.html
图6
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在Matlab文件夹中输入命令“make”,并按下Enter键对文件进行编译,如图7所示,编译成功之后会生成一些.mexw64(对于64位系统)或.mexw32(对于32位系统)文件。
图7 -
至此,LIBSVM安装成功。
LIBSVM测试
执行完上述步骤,LIBSVM即可安装成功。LIBSVM安装成功后,可以用工具包自带的数据集“heart_scale”进行测试。直接在Matlab命令窗口中输入以下指令:
[Label,Feature]=libsvmread(‘D:\tool\libsvm-3.23\heart_scale’);
%读取数据集的标签和特征值;得到的Label为2701的标签矩阵,Feature为27013的特征矩阵,每一列表示一个特征变量
A=randperm(270);
model=svmtrain(Label(A(1:200),1),Feature(A(1:200)😅); %随机挑选200个样本作为训练集,得到训练好的模型model;
[predict_label,accuracy,deci_value]=svmpredict(Label(A(201:270),1),Feature(A(201:270)😅,model);
%剩余的70个样本作为测试集,对训练好的模型进行测试
具体结果如图8所示:
图8
参考文献
[1] Chih-Chung Chang and Chih-Jen Lin, LIBSVM : a library for support vector machines. ACM Transactions on Intelligent Systems and Technology, 2:27:1–27:27, 2011.
总结
支持向量机SVM作为一种有监督学习的二元分类器,在小样本分类中具有突出的优势,因此广泛应用于脑科学领域。
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