基本说明文档

环境启动

• 启动终端
• 启动vscode
  
• 切换python内核
  

代码说明

• 路径 /media/disk1/wzf/Code/cellcycle_250k.ipynb
• 代码块功能详见注释
• 代码中的数据路径需要修改前缀路径

数据说明

• 路径 /media/disk1/wzf/data

相关任务

• 优化指标：

  • 聚类 evaluate模块下cluster/community detection 越大越好
  • 拟时序分析 pesudotime evaluation 越大越好

• 2021.8.14-

  • 处理流程为/media/disk1/wzf/Code/cellcycle_250k.ipynb
  • joint embedding of graphs 结果 直接替换 data preprocess：a representative vectore结果，比较具体评估指标

注意事项

• 原数据文件夹只读不写