列注释_使用eggnog-mapper进行功能注释

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对于许多做非模式生物的同学来说，没有现成的功能注释可用是非常难受的一件事。而blast2go虽然可以一步到位帮你完成功能注释，但它是收费的。这时，我们可以使用eggnog-mapper进行功能注释。

eggnog-mapper现在已经更新到了V2版本，需要在Python2.7环境下运行，并保证有超过40G的存储空间存放数据库。

## 下载eggnog-mapper V2版本
git clone https://github.com/eggnogdb/eggnog-mapper.git

目前，eggNOG数据库已经更新到了5.0版本，收集了更为全面的物种和更多的蛋白序列信息，在进行注释前我们需要先把数据库下载下来。

## 下载
python ./download_eggnog_data.py

直接使用命令下载数据库的话速度非常慢，我们可以使用迅雷或者其他工具下载。
下载地址分别为：
http://eggnogdb.embl.de/download/emapperdb-5.0.0/eggnog.db.gz

http://eggnogdb.embl.de/download/emapperdb-5.0.0/eggnog_proteins.dmnd.gz

下载好后移至eggnog-mapper安装目录的data文件夹下并解压。