https://www.oxfordjournals.org/nar/database/cat/13
牛津大学出版社提供的植物科学相关数据库的汇总网站
http://abc.gao-lab.org/index.php
北京大学应用生物信息学中心
https://www.expasy.org/
瑞士生物信息研究所的生物信息资源门户网站,涵盖各种生物研究数据库和软件工具
http://www.bioinfo.wsu.edu/
作物基因组、遗传和育种研究的分析计算工具和数据库
https://www.agbiodata.org/
农业生物数据库和相关资源综合平台
https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
植物比较基因组学资源库
https://bioinformatics.psb.ugent.be/plaza/
植物比较基因组学数据库
http://www.plantontology.org
集成植物基因组学、表型和遗传学数据的共享型平台
http://harvest.ucr.edu/
作物EST序列及相关分子信息数据平台
http://www.gramene.org/
用于作物和模式物种的比较功能基因组学分析的综合平台
https://www.uniprot.org/
蛋白质序列和功能信息资源数据库和分析平台
http://urgi.versailles.inra.fr/
针对有农学意义的植物研究生物信息平台
http://systemsbiology.cau.edu.cn/agriGOv2/index.php#
GO分析工具包和数据库综合平台
http://www.bioinformatics.nl/AraQTL
基于Web的用于表达定量性状位点(eQTL)研究的工作台和数据库
http://www.plantgdb.org/
植物基因组序列数据库
https://mpss.danforthcenter.org/index.php
二代测序(NGS)数据库,包括植物的RNA和基因组信息资源
http://pgsb.helmholtz-muenchen.de/plant/plantsdb.jsp
植物基因组数据库
http://systemsbiology.cau.edu.cn/chromstates/
植物染色质状态信息数据库
http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home
植物snoRNA基因数据库
http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/
植物顺式调控元件、增强子和抑制子数据库
http://metacrop.ipk-gatersleben.de
作物代谢途径数据库
http://podb.nibb.ac.jp/Organellome
植物器官研究数据库
http://www.drastic.org.uk
植物细胞的信号转导分析数据库
http://www.pathoplant.de
植物-病原体相互作用的信号转导相关物质成分数据库
http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/
植物转录因子数据库
http://plntfdb.bio.uni-potsdam.de/v3.0/
植物转录因子数据库
http://psorf.whu.edu.cn/
植物小型开放阅读框架(sORF)数据资源库
http://uorflight.whu.edu.cn/
植物uORF翻译调控相关数据库
https://apex.ipk-gatersleben.de/apex/f?p=116:1
作物EST数据库
https://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/?action=newplace
植物顺式调控DNA元件数据库
https://webapps.plantenergy.uwa.edu.au/applications/mpic/
植物线粒体蛋白运输元件数据库
https://bioinformatics.cse.unr.edu/fat-ptm
用于分析蛋白质和代谢途径的翻译后修饰数据库
http://sundarlab.ucdavis.edu/smrnas/
谷物特别是水稻和玉米的小RNA数据库
http://ppdb.tc.cornell.edu/default.aspx
拟南芥和玉米蛋白质组数据库
http://atted.jp/
基于互秩指数统计特性的植物共表达数据库
http://ibi.zju.edu.cn/plantcircbase/
植物Circular RNAs数据库
http://plantcrispr.org/cgi-bin/crispr/index.cgi
植物基因编辑数据库,收集CRISPR / Cas9技术产生植物的信息
https://www.try-db.org/TryWeb/Home.php
植物性状全球数据库
http://chibba.agtec.uga.edu/duplication/
植物基因和基因组加倍的数据库
http://www.mirbase.org/
生物microRNA数据库
http://bioinformatics.cau.edu.cn/PMRD/
植物microRNA数据库
http://bis.zju.edu.cn/pmirkb/
模式植物拟南芥和水稻的microRNA数据库
http://genome.ppws.vt.edu/cgi-bin/MLST/home.pl
植物相关微生物的多基因座序列分型和分析数据库及网站
http://structuralbiology.cau.edu.cn/PlantGSEA
植物基因集富集分析平台
http://structuralbiology.cau.edu.cn/PNRD
植物非编码RNA数据库
http://amp.pharm.mssm.edu/datasets2tools/landing/tool/PLncDB
植物长非编码RNA数据库
http://prgdb.org/prgdb/
植物抗病R基因数据库
https://www.inetbio.org/aranet/
拟南芥和一些非模式植物的功能基因网络改进数据库 http://greenc.sciencedesigners.com/wiki/Main_Page
基于Wiki的植物长非编码RNAs数据库
http://ppdb.agr.gifu-u.ac.jp/ppdb/cgi-bin/index.cgi
植物启动子数据库
http://www.pmiren.com/
植物miRNA综合数据库
http://www.mbkbase.org/
水稻、小麦和大豆的分子育种资源库
http://epigenome.genetics.uga.edu/PlantMethylome/
植物DNA甲基化数据库
http//bioinfo.sibs.ac.cn/plant-regulomics
从植物多组学数据中检索获取上游调控因子的数据驱动平台
http://autosnpdb.appliedbioinformatics.com.au/
植物SNP检索数据库
http://www.p3db.org/
植物蛋白磷酸化数据库
http://phytamp.pfba-lab-tun.org/main.php
植物天然抗菌肽数据库
http://bis.zju.edu.cn/pcernadb/index.jsp
植物竞争性内源RNA数据库
http://www.byanbioinfo.org/plamom/
用于检索,分析和预测植物移动大分子包括RNA和蛋白质的数据库平台
https://cvalues.science.kew.org/
用于获取和比较植物基因组大小的数据库
https://plantreactome.gramene.org/index.php?lang=en
植物代谢和调控通路数据库
http://plantpis.ba.itb.cnr.it/
植物蛋白酶抑制剂数据库
http://plantdhs.org/
植物DNase I超敏位点数据库
http://bis.zju.edu.cn/pnatdb/
植物天然反义转录本(Natural Antisense Transcripts)数据库
http://linux1.softberry.com/berry.phtml?topic=plantprom&group=data&subgroup=plantprom
植物启动子数据库
http://www.sesame-bioinfo.org/PMDBase/
用于研究植物物种和基因组进化中的微卫星DNA和标记开发的数据库
http://pogs.uoregon.edu/#/
旨在促进有关植物基因功能和基因模型的跨物种推断的关系数据库
http://plants.proteincomplexes.org/
植物蛋白复合物组分以及蛋白间稳定互作图谱数据库