r语言 林元震_科学网—生态R包spatstat的部分用法（一） - 林元震的博文

前段时间，有个朋友，问我如何用R解决生态学的部分问题，主要是空间生态学的问题。这对我来说，已经跨行了，后来咨询一位生态学钟博士，他给了一点代码，在此基础上，我做了一些分析。关于spatstat包的中文帖子好像没有，于是，写点用法，供有需要的网友参考。

1 数据读取

library(spatstat)

setwd("C:/Users/yzhlin/Desktop/LS")

df

df1

2 径级结构ggplot(df1s,aes(x=Dbh))+

geom_histogram(binwidth=3,color='black',fill='white')

3 空间分布格局

3.1 空间分布点图sp

range(df1s$Xcoor.60),range(df1s$Ycoor.60))

spxy

ggplot(spxy,aes(x,y))+geom_point()

3.2 点格局分析

(1)Ripley’s K(r)函数k

plot(k)

(2)L函数L

plot(L)

(3)双变量的Ripley’s K(r)函数

df1sab

df1sab$S