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原创 单细胞总结
描绘单细胞中的肿瘤微环境 单细胞组学数据库。 其部署了三种在线工具: FastIntegration用于在线数据集成,CELLiD用于在线细胞类型识别,CellMapper用于在线细胞映射。 这些工具使用户能够执行自定义数据集成,并上传自己的数据以进行细胞类型注释和映射到可用的图谱上。基于单细胞免疫组测序的人类T细胞受体(TCR)和B细胞受体(BCR)的数据库。癌症单细胞表达图谱数据库。单细胞全基因组DNA甲基化数据收集、整合、分析和可视化.记录了10个人类组织的21个单细胞数据集的1042 227个单细胞
2022-06-14 09:30:05
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转载 碎片知识篇
免疫学学习网站Thermo Fisher 文章目录前言一、巨噬细胞(Macrophage, M)二、使用步骤1.引入库2.读入数据总结 前言 提示:这里可以添加本文要记录的大概内容: 例如:随着人工智能的不断发展,机器学习这门技术也越来越重要,很多人都开启了学习机器学习,本文就介绍了机器学习的基础内容。 提示:以下是本篇文章正文内容,下面案例可供参考 一、巨噬细胞(Macrophage, M) 链接:巨噬细胞及功能 链接:巨噬细胞综述 M1型(促炎):吞噬细菌等外来物质及凋亡细胞碎片等内源性物质.
2022-06-13 14:01:32
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原创 常用工具整理
文章目录前言一、工具1.在线工具2.客户端工具二、归一化2.不同归一化介绍二、使用步骤1.引入库2.读入数据总结 前言 提示:这里可以添加本文要记录的大概内容: 例如:随着人工智能的不断发展,机器学习这门技术也越来越重要,很多人都开启了学习机器学习,本文就介绍了机器学习的基础内容。 提示:以下是本篇文章正文内容,下面案例可供参考 一、工具 1.在线工具 在线工具:BioLadder 功能包括: 图表分类 数据可视化 组学数据分析 功能分析 数据前处理(长宽表互换、归一化、补值、FDR校正、差异分析
2022-05-07 13:19:54
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原创 数据预处理
提示:文章写完后,目录可以自动生成,如何生成可参考右边的帮助文档 文章目录@[TOC](文章目录)前言一、TCGA官网下载二、UCSC Xena下载1.引入库2.读入数据三、GEO数据下载总结 前言 TCGA + UCSC Xena(GDC)+ GEO + TCGA 提示:以下是本篇文章正文内容,下面案例可供参考 一、TCGA官网下载 下载 1、 2、 二、UCSC Xena下载 1.引入库 代码如下(示例): import numpy as np import pandas as pd i
2022-05-05 21:28:00
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原创 Python入门(一):简介+安装配置+简易程序入门
Python入门(一) 一、简介Python 1.Python适合领域 web网站和网络服务、系
2020-05-22 12:38:31
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空空如也
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