前沿文献分析
文章平均质量分 80
一生雾梦
这个作者很懒,什么都没留下…
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Spatom——利用图神经网络进行蛋白质-蛋白质结合位点预测的新工具
介绍一种蛋白质-蛋白质作用位点结合的新工具Spatom,其发表在Breif in bioinformatics上。利用图神经网络进行预测,在free structure的蛋白质上经过测试,并且允许多链条输入。原创 2024-03-01 03:02:25 · 439 阅读 · 0 评论 -
三代测序原理与数据文件简介(SMRT+Nanopore)
本文主要介绍了三代测序的两种主要方式,Pacbio公司的SMRT测序和Oxford公司的Nanopore测序。从2009年的两篇原始文献开始,介绍了两种测序的基本原理,以及错误的主要来源,并简要的介绍了下机文件的格式。原创 2019-12-03 20:48:42 · 22248 阅读 · 0 评论 -
Hybrid error correction and de novo assembly of single-molecule sequencing reads——文献学习
今天介绍的文献是关于三代测序的拼接算法的研究,或者准确来讲是一个利用二代测序和三代测序结果来拼接基因组序列的方法,当然这篇文章其实只是做了一个部分的创新,大部分拼接的原理是基于已有的拼接算法。当然,这篇文献其实有点旧了,是2012年发表在nature子刊biotechnology上的。标题里的de novo是一个拉丁语貌似,文献中比较喜欢用这个词表示重新、从头开始的意思。single-mole...原创 2019-04-01 22:31:06 · 772 阅读 · 0 评论 -
第七届数学、计算机、生命科学会议(北京)
原创 2019-05-20 09:23:07 · 269 阅读 · 0 评论