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RSS订阅原创 使用SimpleITK对volume文件进行插值处理
本文目的在进行dicom文件分析时，往往会对其进行插值或者重采样处理，可以使用SimpleITK轻松完成。代码如下import SimpleITK as sitkdef getDicomSeriesVolumeImage(folderPath): ''' 读取dicom序列文件 :para folderPath:dicom文件夹 :return volumeImage:volume ''' reader = sitk.ImageSeriesReader() dicomNa
2021-05-05 22:10:11
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原创 使用pydicom读取dicom文件，并且对其pixel数据进行修改并写入
本文目的在进行dicom文件分析时，往往会对其像素内容做预处理，而处理后我们仍要重新写成dicom文件（因为其中还有重要的头信息），这时使用python中的pydicom包便可简单完成。代码如下：import pydicomimport numpy as np## 读取dicom文件，获得metaDatadcmFileInfo = pydicom.dcmread('filename')## 获取像素数据dcmPixelArray = dcmFileInfo.pixel_array## 假
2021-04-09 19:57:49
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原创 01 VTK体绘制（Volume Rendering）+ vtkImagePlaneWidget交互显示横截面
写在前面：我是一个2020年入学的农学学生，读硕后开启了跨学科方向的课题研究：CT。所以一切要开始从头自学：Python、C++、VTK、ITK等。整个过程既富有挑战性，又极其痛苦，为勉励自己不忘初心，追求卓越，不失前进的动力与方向，特开通此博客，记录自己的每一次收获与成长，同时也做一些知识分享，与大家共同进步。本文目的：为在三维使用区域生长分割算法，需要设置种子点，但种子点的寻找需要在二维进行交互寻找，所以这个时候需要先将Dicom序列文件进行体绘制（Volume Rendering）,随后通过VT
2021-04-05 20:20:02
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空空如也
空空如也
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