PETSc: Cygwin环境下安装实践

Cygwin环境下安装实践

方便学习使用PETSc，在Cygwin环境下进行安装实践。

用py进行配置，config/examples下面有多种环境下的py脚本可参考修改

环境	说明	备忘
py配置脚本	arch-ci-mswin-gnu.py	进行适当修改
gcc	11.3.0
openmpi		保证用mpicc/mpicxx/mpif90编译连接MPI程序成功
zlib-devel,libhwloc-devel,libevent-devel	openmpi的依赖库	openmpi需要依赖库(mpicc -showme)，保证已经安装，安装openmpi并不能保证这些依赖已经安装(坑)
cygchek -c		能列出cygwin所有安装包

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arch-ci-mswin-gnu.py内容

#!/usr/bin/env python3

configure_options = [
  # Autodetect cygwin blas/lapack, OpenMPI
  '--with-debugging=0',
  '--with-make-np=4',
  '--with-cc=/usr/bin/mpicc',
  '--with-cxx=/usr/bin/mpicxx',
  '--with-fc=/usr/bin/mpif90',
  '--COPTFLAGS=-O3 -march=native',
  '--CXXOPTFLAGS=-O3 -march=native',
  '--FOPTFLAGS=-O3 -march=native',
  'FFLAGS=-fno-backtrace -ffree-line-length-0',
  '--download-metis',
  #'--download-mumps=$HOME/github.dir/petsc/MUMPS_5.5.0.tar.gz',
  '--download-parmetis',
  #'--download-scalapack',
  '--download-fblaslapack',
  '--with-cxx-dialect=C++14',
  '--with-shared-libraries=0',
  ]

if __name__ == '__main__':
  import sys,os
  sys.path.insert(0,os.path.abspath('config'))
  import configure
  configure.petsc_configure(configure_options)

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碰到的坑备忘

• openmpi安装后，有几个依赖包要独立安装好，保证mpicc/mpicxx/mpif90能编译连接成功
• 碰到问题仔细阅读PETSc的配置日志configure.log
• PETSc自动下载第三方包时候，会失败，可以手动将包下载后，指定具体位置（碰到MUMPS包下载失败情况)
• Cygwin没有openblas-devel包，PETSc找不到blas头文件，使用了PETSc自动下载的fblaslapack第三方包
• mumps包需要scalapack, scalapack编译有问题，可剔除mumps
• 编译静态库,动态库可能有问题(–with-shared-libraries=0）