生信概念记录(PK、PD、perpetrator、victim)

Drug-Drug Interaction(DDI)是基于pharmacokinetics (PK) and pharmacodynamics (PD)的,那么PK、PD分别是什么?

pharmacokinetics (PK)

翻译成中文是:药代动力学

------Specifically, PK describes the body’s response to a drug, including absorption, distribution, metabolism and excretion.

即身体对药物的反应,包括吸收、分布、代谢和排泄.

pharmacodynamics (PD)

翻译成中文是:药效学

whereas PD refers to the study of the biochemical, physiologic and molecular effects of drugs on the body, including receptor binding, postreceptor effects and chemical interactions [21, 22].

药物在身体上的生化、生理及分子影响研究,包括受体结合、受体后效应以及化学相互作用

对于成功预测 DDI 而言,明确建模 PK 和 PD 相关数据非常重要。

对于PK,还会出现两个词汇:"perpetrator" 和 "victim",在生物信息学领域,这两个词汇通常用于描述药物代谢动力学(PK)中的相互作用

(1)"perpetrator" 指的是影响另一个药物代谢的药物,即“肇事者”

(2)"victim" 指的是受到这种影响的药物,即“受害者”

在阅读Learning motif-based graphs for drug–drug interaction prediction via local–global self-attention论文中,"To quantify the impact of the perpetrator on the PK of the victim" 意思是要量化perpetrator “肇事者”对victim“受害者”药物代谢动力学的影响。这通常涉及到药物相互作用的研究,其中一种药物可能会改变另一种药物的代谢速率,从而影响其在体内的浓度和效果。

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