matlab调用R给散点图画95%置信椭圆(95% confidence ellipse in a scatterplot)

本文介绍了如何在R中利用ggplot2和ggforce包来绘制95%置信椭圆,分别展示了geome_mark_ellipse和statEllipse函数的用法。此外,还探讨了在MATLAB中通过调用R进行绘图的方法,提到了RunRcode工具箱的使用,并提供了相关代码示例和资源链接。文章不仅涵盖了R语言的图形绘制,还涉及了跨语言的数据可视化操作。
摘要由CSDN通过智能技术生成

1. 利用R绘制95%置信椭圆

其他资料:
How to draw a 95% confidence ellipse? (这是个问答,有人给出了除R之外的绘图方法)
Can I add 95% confidence ellipses around groups of data in a PCA biplot? (matlab在PCA的bioplot中画置信椭圆,内有参考代码)
ggplot2的介绍
ggplot2修改图例形状
ggplot2去掉背景色及网格线

2. matlab调用R

可参考知乎上这个回答
其实核心就是下面一句命令

RunRcode(RscriptFileName, Rpath); 

(其中RunRcode是一个工具箱,可以自行在matlab的file exchange中下载,RscriptFileName就是待调用的R文件的完整路径,Rpath是R.exe所在文件夹路径),举例:

Rpth='D:\install\R\R-4.1.3\bin';
RscriptFileName='F:\demo1.R';
RunRcode(RscriptFileName, Rpath);
matlab中,可以使用plot函数绘制散点图,并利用它来置信边界。 首先,我们需要明确散点图的数据点和置信边界的定义。数据点是我们要研究的样本数据集,它由一组横坐标和纵坐标组成。置信边界是对样本数据的统计分析结果,用于表示潜在的真实数据分布范围。 在绘制散点图之前,我们可以使用一些matlab中的统计函数来对数据进行分析,例如计算均值、方差等。然后,我们可以利用这些统计结果来计算置信边界。 一种常用的方法是使用高斯分布的性质来计算置信边界。假设样本数据服从正态分布,可以根据样本数据的均值和方差计算出置信区间。置信区间表示数据点在一定置信水平下的范围。 具体地,我们可以使用norminv函数计算出给定置信水平下的分位数,以此来确定置信边界的上下限。然后,我们可以在散点图上使用plot函数绘制出置信边界线。 例如,假设已有一组样本数据x和对应的概率密度值y,我们可以通过以下代码来绘制散点图置信边界: ```matlab % 计算置信边界 alpha = 0.95; % 置信水平为95% mu = mean(x); % 计算均值 sigma = std(x); % 计算标准差 ci = norminv([(1-alpha)/2, 1-(1-alpha)/2], mu, sigma); % 计算置信区间 % 绘制散点图置信边界 figure scatter(x, y, 'filled') % 绘制散点图 hold on plot([min(x), max(x)], [ci(1), ci(1)], 'r--') % 绘制置信边界上界 plot([min(x), max(x)], [ci(2), ci(2)], 'r--') % 绘制置信边界下界 hold off % 添加标签和标题 xlabel('横坐标') ylabel('纵坐标') title('散点图置信边界') ``` 以上代码中,我们使用scatter函数绘制散点图,'filled'参数表示填充数据点。然后使用hold on和hold off来保持散点图的同时绘制置信边界。在plot函数中,我们使用红色虚线来表示置信边界。 最后,我们可以通过添加标签和标题来完善图形的展示。可以根据实际需要调整参数,例如置信水平、颜色、线型等,以满足具体的要求。 综上所述,matlab提供了灵活且方便的绘图函数,可以用于绘制散点图置信边界。
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