LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)是一款开源的分子动力学模拟软件,广泛应用于材料科学、化学和物理学等领域。lattice
命令用于定义晶格结构,这对于构建周期性晶体结构非常有用。
lattice
命令的基本语法
lattice style keyword values ...
style
参数
lattice
命令接受不同的晶格类型,包括但不限于:
- sc: 简单立方(Simple Cubic)
- bcc: 体心立方(Body-Centered Cubic)
- fcc: 面心立方(Face-Centered Cubic)
- diamond: 金刚石结构
- hex: 六角密堆积(Hexagonal Close-Packed, HCP)
- tri: 三斜晶系(Triclinic)
- ortho: 正交晶系(Orthorhombic)
- tet: 四方晶系(Tetragonal)
- tric: 三方晶系(Trigonal)
关键字及值
关键字及其对应的值用于定义晶格的具体参数,例如:
- a: 晶格常数
- b: 第二个晶格常数(正交、四方等)
- c: 第三个晶格常数(正交、四方等)
- alpha: 第一个角度(单位为度)
- beta: 第二个角度(单位为度)
- gamma: 第三个角度(单位为度)
示例
创建一个简单的面心立方(FCC)结构
lattice fcc a 3.615
region box block -5 5 -5 5 -5 5
create_box 1 box
create_atoms 1 box
lattice fcc a 3.615
: 定义了一个面心立方晶格,晶格常数a
为 3.615。region box block -5 5 -5 5 -5 5
: 定义了一个立方体区域,范围从 -5 到 +5。create_box 1 box
: 根据定义的区域创建了一个模拟盒。create_atoms 1 box
: 在模拟盒内创建原子。
创建一个体心立方(BCC)结构
lattice bcc a 3.0
region box block -5 5 -5 5 -5 5
create_box 1 box
create_atoms 1 box
lattice bcc a 3.0
: 定义了一个体心立方晶格,晶格常数a
为 3.0。region box block -5 5 -5 5 -5 5
: 定义了一个立方体区域。create_box 1 box
: 创建了一个模拟盒。create_atoms 1 box
: 在模拟盒内创建原子。
创建一个正交晶系(Orthorhombic)结构
lattice ortho a 3.0 b 4.0 c 5.0
region box block -5 5 -5 5 -5 5
create_box 1 box
create_atoms 1 box
lattice ortho a 3.0 b 4.0 c 5.0
: 定义了一个正交晶系,晶格常数分别为a
为 3.0,b
为 4.0,c
为 5.0。region box block -5 5 -5 5 -5 5
: 定义了一个立方体区域。create_box 1 box
: 创建了一个模拟盒。create_atoms 1 box
: 在模拟盒内创建原子。
注意事项
-
晶格常数:
- 晶格常数应根据实际材料进行调整。
-
区域大小:
- 区域的大小应该足够大,以容纳完整的晶格结构。
-
周期性边界条件:
- LAMMPS 默认使用周期性边界条件