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原创 深度学习中的各种学习技术:监督学习、无监督学习、半监督学习、主动学习、自监督学习............
连续学习、增量学习、终身学习(Continual Learning、Incremental Learning 和 Lifelong Learning)在线学习(Online Learning)meta-learning(元学习)
2024-01-06 15:09:36
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原创 NCBI数据集说明
NCBI 就是。,提供数据库、网页检索、下载、API 和命令行工具,里面包含基因、基因组、变异、文献、表达数据等很多资源。你前面看的,就是 NCBI 旗下的一个数据库。ClinVar 自己说明,数据既可以在网页上看,也可以通过,还可以通过访问。先区分:NCBI 不是一个单独“数据集”,它更像一个“总平台”。
2026-04-12 22:00:44
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原创 SpliceVarDB数据集说明
这个网址。主页上直接写了,用户可以提交已发表、预印本或未发表但有支持证据的、,并在人工审核后纳入数据库。:更广义的临床变异数据库,关注致病性、临床解释、疾病关联等:更专门,重点是,而且强调。
2026-04-12 21:28:21
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原创 clinvar数据集说明
先说 ClinVar 是什么:ClinVar 是 NCBI 的一个变异数据库,核心是把整理出来,比如某个变异是否致病、和什么疾病相关、证据来自谁提交等。这个下载页就是让你批量拿这些数据。,它们不是不同的数据集,而是。页面把下载分成 4 大类:XML、VCF、ClinVar TSV、Other TSV。
2026-04-12 21:18:48
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原创 DNA/RNA/基因中的一些名词
比如你看到某个 DNA 变异落在 ENCODE 的开放染色质区域、TF binding 区域、增强子区域,就常常说明这个位点。,用来描述 DNA 哪些区域“在起作用”。你可以把它们理解成:从不同角度观察基因组是否活跃、是否可被结合、是否在驱动转录。先用抗体把“你关心的蛋白 + 它结合的那段 DNA”一起抓出来,再把这些 DNA 测序,最后定位回基因组。用一种转座酶(Tn5)优先插入开放区域,再把这些插入到的 DNA 片段测序。:更常用、样本需求更低、流程更方便的开放染色质技术。
2026-04-12 11:37:48
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原创 DNA中的保守(conserved)是什么意思?
比如人、鼠、狗、鸡这些物种在某个位置上都差不多,那就说明这个位置可能比较重要。它会给基因组上每个位置一个分数,表示这个位置看起来有多保守。因为如果它不重要,进化过程中通常更容易随便变。phastCons 是一种。
2026-03-31 16:07:32
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原创 github怎么授权ssh(私人库授权)
这样后面通常就不会再让你输入 GitHub 用户名和密码了。GitHub 官方说明,仓库可以用 SSH URL 来 clone。Hi 你的GitHub用户名!You've successfully authenticated...,其实可以直接复用;没有的话就继续下一步。GitHub 官方也是先建议检查已有密钥。GitHub 官方文档也是用这个命令测试连接,并说明成功信息里会包含你的用户名。ssh-keygen -t ed25519 -C "你的GitHub邮箱"GitHub 文档当前示例也是这个。
2026-03-22 08:25:20
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原创 电脑卡顿,应该怎么修复
使用geek pro将不用的软件卸载(同时需要将注册表也删除)【例如不用的nvidia cuda11...】,然后就会快很多。背景:我的电脑配置很高,但是在切换页面等日常操作还不如普通的电脑快,一直找不到原因。
2026-03-07 16:56:31
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原创 vscode配置无密码sftp远程服务器+使用秘钥使用远程服务器(WSL版本)
将公钥发送到服务器(端口 30680)# 确保私钥权限正确(必须是 600)
2026-03-06 11:57:15
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原创 某些python的包安装不上怎么办?Linux的某个底层版本很低
没有 wheel:pip 会立刻报 “No matching distribution found”,提醒你别再走源码编译这条路(改用 conda-forge、换 Python 版本、或换更新环境/容器)】例如 pip install --only-binary 安装不上,然后conda install --only-binary 也安装不上。有 wheel:pip 直接装,成功。
2026-02-06 09:35:06
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原创 电脑主板有滋滋的声音
oc->cpu->intel c-state -> 禁止 (apic bios 电源管理cpu 空闲减少cpu功耗)oc->cpu->c1e支援->禁止 (空闲降低cpu频率和电压)
2026-02-02 08:52:29
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原创 DNA相关都有什么任务?
增强子通常距离它调控的基因很远(可达 1 Mb),通过接触图可以理解它们是如何在三维空间中“见面”并发挥作用的。[图1d]:预测序列中的特定位置是否为剪接供体(donor)或受体(acceptor)位点。[图1e]:预测 mRNA 尾部的切割和加尾位置,这决定了 mRNA 的稳定性和翻译效率。[图1e]:预测变异如何破坏或创造转录因子的结合位点(即破坏或创造 Motif)。[图1d]:预测转录起始位点(TSS)的位置和强度,反映启动子活性。[图1d]:预测转录因子在 DNA 上的结合位点。
2026-02-01 09:02:38
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原创 DNA具体怎么转为蛋白质的?
剪切好的mRNA会进入到细胞质中,剪切好的mRNA中的碱基每3个为一组密码子,由起始密码子开始,终止密码子结束,每1个密码子对应一个氨基酸,这样很多氨基酸就聚集在一起从而形成多肽,蛋白质。DNA要翻译为蛋白质,首先需要解开DNA的双螺旋结构(RNA聚合酶解开),然后细胞核中游离的碱基就会和DNA的单链结合(区别在于A要和U结合),然后就得到了信使RNA(mRNA)。剪接体的蛋白质把mRNA中不能编译的内含子弄走,剩下可以翻译蛋白质的片段,叫做外显子。
2026-01-31 20:27:46
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原创 从糖类、分子一直理解到人类染色体
单糖是糖类(碳水化合物)中最简单的分子单位,不能再被水解成更小的糖。核糖和脱氧核糖完全是由碳 (C)、氢 (H)、氧 (O) 三种元素组成的(也可以认为是是单糖的其他形式)。虽然它们非常相似,但正如名字所暗示的,脱氧核糖比核糖少了一个氧原子。名称化学式存在于关键特征核糖 (Ribose)C5H10O5RNA2号碳原子上连接的是羟基 (-OH)脱氧核糖 (Deoxyribose)C5H10O4DNA2号碳原子上连接的是氢 (-H),失去了一个氧类别代表物质分子式角色/关系五碳单糖。
2026-01-31 08:47:33
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原创 微调的方式有哪些?(Lora...)
│ [🔥P₁] [🔥P₂] [🔥P₃] ... [🔥Pₖ] │ ← 可训练的prompt embeddings。[P1, P2, P3, ..., Pk, The, movie, is, great] → Encoder → 输出。│ [❄️The] [❄️movie] [❄️is] [❄️great] │ ← 真实输入(正常处理)│ W·x (输出) │。│ 原始Linear层 (W: 4096×4096) │。
2026-01-11 11:13:08
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原创 WSL 磁盘扩容: [Errno 28] No space left on device、将不重要的删除、增加磁盘
diskpart然后在这个里面运行:查看信息:扩容到10T然后再退出即可exit。
2025-12-27 13:54:44
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原创 怎么让网线与WiFi同时使用网速翻倍
这里的网速翻倍只是在多线程的时候是翻倍,不会让你单个下载的文件速度更快,但是可以解决一边看电视,一边做其他事情的时候网速更快。
2025-11-24 09:10:20
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原创 vscode怎么连接远程服务器/无密码(使用秘钥)登录 + 带有跳板机的连接
如果你本地已经有了id_rsaid_rsa.pub(文件会存在:)就不需要再配置一遍了如果没有就:在本地的cmd电脑输入:然后按三次回车id_rsa(私钥,泄露给别人)id_rsa.pub(公钥,这个是我们要放到服务器上去的)
2025-11-21 10:44:11
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原创 租赁的服务器多核心运行卡住不动/cpu占用不够,不占用cpu
我默认多核心处理数据或者训练的时候会使用全部核心数,但是你租赁的服务器其实没有这么多核心给你,因为有的已经被别人租赁了,所以此时你需要手动指定核心数,例如是16线程的,你就指定:
2025-11-16 18:37:29
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原创 【异常错误】可以安装CUDA12就不要安装CUDA11
我以为应该不是我的本地电脑的问题,应该就是驱动或者CUDA、torch版本问题,然后我核查了一下,发现虽然都是torch2.4,但是远程的是CUDA12.4的版本的,我的是CUDA11.8版本的。可以看到CUDA版本是不一样的,所以需要先uninstall torch,然后再重新输入这个命令就可以了。今天在运行代码的时候,发现我的本地电脑和远程的电脑,运行速度以及所占的显存完全不一样。
2025-11-14 10:36:18
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原创 过拟合常用的方法
例如模型在training上很好,但是在valid、test很差或者是在train上loss一直下降,但是在valid上loss基本不变。
2025-11-05 15:59:52
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原创 vscode默认使用typora打开md(Markdown)文件、vscode中打开Markdown怎么默认使用typora打开
然后选择一个你的md文件,然后右键打开方式。先安装typora插件。然后选择配置默认编辑器。
2025-11-04 14:47:57
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原创 怎么看硬盘当前是否是pcie4.0还是3.0?怎么换成4.0?
我刚开始是用我的工具测试我的硬盘的速度,发现我的4.0的速度很慢,基本上只有3000M左右。
2025-10-15 11:23:39
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图像生成中的“Classifer guidance、Classifer-free guidance”是什么?
2024-03-20
pycharm运行命令进行debug
2023-04-20
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