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原创 深度学习中的各种学习技术:监督学习、无监督学习、半监督学习、主动学习、自监督学习............

连续学习、增量学习、终身学习(Continual Learning、Incremental Learning 和 Lifelong Learning)在线学习(Online Learning)meta-learning(元学习)

2024-01-06 15:09:36 805 2

原创 整理张量(tensor)中常用的操作

维度变换。

2023-05-04 09:31:43 1392 1

原创 NCBI数据集说明

NCBI 就是。,提供数据库、网页检索、下载、API 和命令行工具,里面包含基因、基因组、变异、文献、表达数据等很多资源。你前面看的,就是 NCBI 旗下的一个数据库。ClinVar 自己说明,数据既可以在网页上看,也可以通过,还可以通过访问。先区分:NCBI 不是一个单独“数据集”,它更像一个“总平台”。

2026-04-12 22:00:44 7

原创 SpliceVarDB数据集说明

这个网址。主页上直接写了,用户可以提交已发表、预印本或未发表但有支持证据的、,并在人工审核后纳入数据库。:更广义的临床变异数据库,关注致病性、临床解释、疾病关联等:更专门,重点是,而且强调。

2026-04-12 21:28:21 12

原创 clinvar数据集说明

先说 ClinVar 是什么:ClinVar 是 NCBI 的一个变异数据库,核心是把整理出来,比如某个变异是否致病、和什么疾病相关、证据来自谁提交等。这个下载页就是让你批量拿这些数据。,它们不是不同的数据集,而是。页面把下载分成 4 大类:XML、VCF、ClinVar TSV、Other TSV。

2026-04-12 21:18:48 10

原创 DNA/RNA/基因中的一些名词

比如你看到某个 DNA 变异落在 ENCODE 的开放染色质区域、TF binding 区域、增强子区域,就常常说明这个位点。,用来描述 DNA 哪些区域“在起作用”。你可以把它们理解成:从不同角度观察基因组是否活跃、是否可被结合、是否在驱动转录。先用抗体把“你关心的蛋白 + 它结合的那段 DNA”一起抓出来,再把这些 DNA 测序,最后定位回基因组。用一种转座酶(Tn5)优先插入开放区域,再把这些插入到的 DNA 片段测序。:更常用、样本需求更低、流程更方便的开放染色质技术。

2026-04-12 11:37:48 269

原创 H20服务器多卡运行有错误gpu_partition ,tmux错误

【代码】H20服务器多卡运行有错误gpu_partition。

2026-04-06 08:24:15 81

原创 Autoruns自启动/进程控制软件怎么使用?

当前的意思是开机到现在已经在运行的进程登录的意思是开机以后会自动启动的软件。

2026-04-04 08:23:30 24

原创 Linux在一个容器中创建一个子用户

不要在home下创建,因为后面会被删除。

2026-04-01 21:40:45 78

原创 COM Surrogate的dllhost.exe高占用(磁盘)解决

勾选上就行了。

2026-03-31 20:48:11 38

原创 DNA中的保守(conserved)是什么意思?

比如人、鼠、狗、鸡这些物种在某个位置上都差不多,那就说明这个位置可能比较重要。它会给基因组上每个位置一个分数,表示这个位置看起来有多保守。因为如果它不重要,进化过程中通常更容易随便变。phastCons 是一种。

2026-03-31 16:07:32 27

原创 WPS打开文件很慢

然后选择高级

2026-03-27 19:12:18 33

原创 内网服务器怎么连接外网

然后在内网和外网都下载一份。

2026-03-25 19:54:38 382

原创 github怎么授权ssh(私人库授权)

这样后面通常就不会再让你输入 GitHub 用户名和密码了。GitHub 官方说明,仓库可以用 SSH URL 来 clone。Hi 你的GitHub用户名!You've successfully authenticated...,其实可以直接复用;没有的话就继续下一步。GitHub 官方也是先建议检查已有密钥。GitHub 官方文档也是用这个命令测试连接,并说明成功信息里会包含你的用户名。ssh-keygen -t ed25519 -C "你的GitHub邮箱"GitHub 文档当前示例也是这个。

2026-03-22 08:25:20 258

原创 vscode插件突然安装不上

将本地的clash退出,然后将设置中的。

2026-03-13 08:29:42 31

原创 电脑卡顿,应该怎么修复

使用geek pro将不用的软件卸载(同时需要将注册表也删除)【例如不用的nvidia cuda11...】,然后就会快很多。背景:我的电脑配置很高,但是在切换页面等日常操作还不如普通的电脑快,一直找不到原因。

2026-03-07 16:56:31 49

原创 vscode配置无密码sftp远程服务器+使用秘钥使用远程服务器(WSL版本)

将公钥发送到服务器(端口 30680)# 确保私钥权限正确(必须是 600)

2026-03-06 11:57:15 70

原创 核酸、核酸适配体、DNA的关系

是一个大类:DNA、RNA 以及各种长度的寡核苷酸、多核苷酸。属于其中的一个子集:通常是。

2026-03-06 10:00:14 41

原创 某些python的包安装不上怎么办?Linux的某个底层版本很低

没有 wheel:pip 会立刻报 “No matching distribution found”,提醒你别再走源码编译这条路(改用 conda-forge、换 Python 版本、或换更新环境/容器)】例如 pip install --only-binary 安装不上,然后conda install --only-binary 也安装不上。有 wheel:pip 直接装,成功。

2026-02-06 09:35:06 165

原创 怎么使用git下载huggingface的文件

Ubuntu# 初始化。

2026-02-02 11:17:28 401

原创 电脑主板有滋滋的声音

oc->cpu->intel c-state -> 禁止 (apic bios 电源管理cpu 空闲减少cpu功耗)oc->cpu->c1e支援->禁止 (空闲降低cpu频率和电压)

2026-02-02 08:52:29 214

原创 DNA相关都有什么任务?

增强子通常距离它调控的基因很远(可达 1 Mb),通过接触图可以理解它们是如何在三维空间中“见面”并发挥作用的。[图1d]:预测序列中的特定位置是否为剪接供体(donor)或受体(acceptor)位点。[图1e]:预测 mRNA 尾部的切割和加尾位置,这决定了 mRNA 的稳定性和翻译效率。[图1e]:预测变异如何破坏或创造转录因子的结合位点(即破坏或创造 Motif)。[图1d]:预测转录起始位点(TSS)的位置和强度,反映启动子活性。[图1d]:预测转录因子在 DNA 上的结合位点。

2026-02-01 09:02:38 761

原创 DNA具体怎么转为蛋白质的?

剪切好的mRNA会进入到细胞质中,剪切好的mRNA中的碱基每3个为一组密码子,由起始密码子开始,终止密码子结束,每1个密码子对应一个氨基酸,这样很多氨基酸就聚集在一起从而形成多肽,蛋白质。DNA要翻译为蛋白质,首先需要解开DNA的双螺旋结构(RNA聚合酶解开),然后细胞核中游离的碱基就会和DNA的单链结合(区别在于A要和U结合),然后就得到了信使RNA(mRNA)。剪接体的蛋白质把mRNA中不能编译的内含子弄走,剩下可以翻译蛋白质的片段,叫做外显子。

2026-01-31 20:27:46 328

原创 从糖类、分子一直理解到人类染色体

单糖是糖类(碳水化合物)中最简单的分子单位,不能再被水解成更小的糖。核糖和脱氧核糖完全是由碳 (C)、氢 (H)、氧 (O) 三种元素组成的(也可以认为是是单糖的其他形式)。虽然它们非常相似,但正如名字所暗示的,脱氧核糖比核糖少了一个氧原子。名称化学式存在于关键特征核糖 (Ribose)C5H10O5RNA2号碳原子上连接的是羟基 (-OH)脱氧核糖 (Deoxyribose)C5H10O4DNA2号碳原子上连接的是氢 (-H),失去了一个氧类别代表物质分子式角色/关系五碳单糖。

2026-01-31 08:47:33 188

原创 微调的方式有哪些?(Lora...)

│ [🔥P₁] [🔥P₂] [🔥P₃] ... [🔥Pₖ] │ ← 可训练的prompt embeddings。[P1, P2, P3, ..., Pk, The, movie, is, great] → Encoder → 输出。│ [❄️The] [❄️movie] [❄️is] [❄️great] │ ← 真实输入(正常处理)│ W·x (输出) │。│ 原始Linear层 (W: 4096×4096) │。

2026-01-11 11:13:08 802

原创 WSL 磁盘扩容: [Errno 28] No space left on device、将不重要的删除、增加磁盘

diskpart然后在这个里面运行:查看信息:扩容到10T然后再退出即可exit。

2025-12-27 13:54:44 293

原创 怎么搜索某个已知的药物的smiles

https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/

2025-12-23 19:20:24 366

原创 vscode通过跳板机连接到服务器

打开设置,搜索remote.SSH.localServerDownload,设置为always。

2025-12-07 19:30:23 451

原创 怎么让网线与WiFi同时使用网速翻倍

这里的网速翻倍只是在多线程的时候是翻倍,不会让你单个下载的文件速度更快,但是可以解决一边看电视,一边做其他事情的时候网速更快。

2025-11-24 09:10:20 423

转载 浏览器怎么批量得到+下载某些链接(迅雷)?迅雷怎么设置代理?

首先需要下载插件。

2025-11-22 11:54:09 538

原创 vscode按住左键然后移动鼠标选择文本不管用了

按一下insert键位,然后发现可以选择了,然后再按一下insert键位就可以了。

2025-11-21 14:53:13 309

原创 vscode怎么连接远程服务器/无密码(使用秘钥)登录 + 带有跳板机的连接

如果你本地已经有了id_rsaid_rsa.pub(文件会存在:)就不需要再配置一遍了如果没有就:在本地的cmd电脑输入:然后按三次回车id_rsa(私钥,泄露给别人)id_rsa.pub(公钥,这个是我们要放到服务器上去的)

2025-11-21 10:44:11 706

原创 租赁的服务器多核心运行卡住不动/cpu占用不够,不占用cpu

我默认多核心处理数据或者训练的时候会使用全部核心数,但是你租赁的服务器其实没有这么多核心给你,因为有的已经被别人租赁了,所以此时你需要手动指定核心数,例如是16线程的,你就指定:

2025-11-16 18:37:29 174

原创 【异常错误】可以安装CUDA12就不要安装CUDA11

我以为应该不是我的本地电脑的问题,应该就是驱动或者CUDA、torch版本问题,然后我核查了一下,发现虽然都是torch2.4,但是远程的是CUDA12.4的版本的,我的是CUDA11.8版本的。可以看到CUDA版本是不一样的,所以需要先uninstall torch,然后再重新输入这个命令就可以了。今天在运行代码的时候,发现我的本地电脑和远程的电脑,运行速度以及所占的显存完全不一样。

2025-11-14 10:36:18 303

原创 过拟合常用的方法

例如模型在training上很好,但是在valid、test很差或者是在train上loss一直下降,但是在valid上loss基本不变。

2025-11-05 15:59:52 221

原创 vscode默认使用typora打开md(Markdown)文件、vscode中打开Markdown怎么默认使用typora打开

然后选择一个你的md文件,然后右键打开方式。先安装typora插件。然后选择配置默认编辑器。

2025-11-04 14:47:57 471

原创 浏览器插件中的篡改猴的脚本是灰色的

需要把这个打开。

2025-10-31 14:27:30 685

原创 使用飞书机器人进行 - ArXiv自动化检索推荐

设置机器人头像、名称、描述,点击。

2025-10-23 10:20:10 455

原创 怎么看硬盘当前是否是pcie4.0还是3.0?怎么换成4.0?

我刚开始是用我的工具测试我的硬盘的速度,发现我的4.0的速度很慢,基本上只有3000M左右。

2025-10-15 11:23:39 912

原创 codex怎么预定义提示词?例如中文回复

这个你可以直接在终端告诉它一直使用中文回复,但是重启之后可能就失效了。

2025-10-10 09:25:26 4830

Zotero tags(action and tags for zotero)怎么使用

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2024-09-03

图像生成中的“Classifer guidance、Classifer-free guidance”是什么?

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2024-03-20

一文弄懂 Diffusion Model(DDPM)+ 代码实现

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2024-03-02

AE(自动编码器)与VAE(变分自动编码器)的区别和联系?

PPT

2024-02-28

pycharm调整漂亮的颜色主题

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2024-01-12

pycharm调整漂亮的颜色主题

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2024-01-05

pycharm调整漂亮的颜色主题

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2024-01-05

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2024-01-05

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2023-12-09

Endnote修改参考文献(References)的期刊全称为缩写

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2023-10-05

使用endnote编辑Nature Communication的参考文献格式

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2023-09-06

pan assay interference compounds (PAINS)

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2023-08-07

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