cdk&java | 实现化学反应中的片段分组

最新推荐文章于 2023-02-24 15:08:16 发布
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分类专栏： AIDD | CADD | 化学 | 生物 文章标签： java 大数据 开发语言
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本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_43236007/article/details/125601886
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本文介绍了如何利用CDK库和Java编程语言进行化学反应中的片段分组操作，通过CXSMILES表示法展示未分组和已分组的SMILES字符串，并给出了相关代码示例。
摘要由CSDN通过智能技术生成

片段分组

片段分组（或组分分组）允许将分子的单独片段/组分组合在一起。 它对于反应表示至关重要，因此出现了几个独立的 SMILES 扩展。 常见的情况包括将离子、水合物和盐作为一个“分子”保持在一起。

没有进行分组的smiles

在这里插入图片描述

进行分组的smiles

在这里插入图片描述

我们可以使用CXSMILES来组合片段，她的表示方法是

[Na+].[OH-

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