大数据之Spark:spark shuffle的优化

1.问题:spark shuffle如何优化?

2.分析:

可以从两方面考虑,第一方面宽依赖算子可以产生shuffle,我们可以从算子的角度,进行优化;
第二方面产生shuffle了怎么半,我们可以从参数调优方面考虑;

3.优化方案

3.1:算子方面

1)当进行联合的规约操作时,避免使用 groupByKey。
举个例子,rdd.groupByKey().mapValues(_ .sum) 与 rdd.reduceByKey(_ + _) 执行的结果是一样的,但是前者需要把全部的数据通过网络传递一遍,而后者只需要根据每个 key 局部的 partition 累积结果,在 shuffle 的之后把局部的累积值相加后得到结果.
2)当输入和输入的类型不一致时,避免使用 reduceByKey。
举个例子,我们需要实现为每一个key查找所有不相同的 string。一个方法是利用 map 把每个元素的转换成一个 Set,再使用 reduceByKey 将这些 Set 合并起来10.
3) 生成新列的时候,避免使用单独生成一列再 join 回来的方式,而是直接在数据上生成.
4) 当需要对两个 RDD 使用 join 的时候,如果其中一个数据集特别小,小到能塞到每个 Executor 单独的内存中的时候,可以不使用 join, 使用 broadcast 操作将小 RDD 复制广播到每个 Executor 的内存里 join.

3.2:参数调优

1)spark.shuffle.file.buffer
参数说明:该参数用于设置shuffle write task的BufferedOutputStream的buffer缓冲大小(默认值:32k)。将数据写到磁盘文件之前,会先写入buffer缓冲中待缓冲写满之后,才会溢写到磁盘。
调优建议:如果作业可用的内存资源较为充足的话,可以适当增加这个参数的大小(比如64k),从而减少shuffle write过程中溢写磁盘文件的次数,也就可以减少磁盘IO次数,进而提升性能。在实践中发现,合理调节该参数,性能会有1%~5%的提升。

2)spark.reducer.maxSizeInFlight
参数说明:该参数用于设置shuffle read task的buffer缓冲大小(默认值:48m),而这个buffer缓冲决定了每次能够拉取多少数据。
调优建议:如果作业可用的内存资源较为充足的话,可以适当增加这个参数的大小(比如96m),从而减少拉取数据的次数,也就可以减少网络传输的次数,进而提升性能。在实践中发现,合理调节该参数,性能会有1%~5%的提升。

3)spark.shuffle.io.maxRetries
参数说明:shuffle read task从shuffle write task所在节点拉取属于自己的数据时,如果因为网络异常导致拉取失败,是会自动进行重试的。该参数就代表了可以重试的最大次数( 默认值:3)。如果在指定次数之内拉取还是没有成功,就可能会导致作业执行失败。
调优建议:对于那些包含了特别耗时的shuffle操作的作业,建议增加重试最大次数(比如60次),以避免由于JVM的full gc或者网络不稳定等因素导致的数据拉取失败。在实践中发现,对于针对超大数据量(数十亿~上百亿)的shuffle过程,调节该参数可以大幅度提升稳定性。

4)spark.shuffle.io.retryWait
参数说明:具体解释同上,该参数代表了每次重试拉取数据的等待间隔,默认是5s。
调优建议:建议加大间隔时长(比如60s),以增加shuffle操作的稳定性。

5)spark.shuffle.memoryFraction
参数说明:该参数代表了Executor内存中,分配给shuffle read task进行聚合操作的内存比例,默认是20%。
调优建议:在资源参数调优中讲解过这个参数。如果内存充足,而且很少使用持久化操作,建议调高这个比例,给shuffle read的聚合操作更多内存, 以避免由于内存不足导致聚合过程中频繁读写磁盘。在实践中发现,合理调节该参数可以将性能提升10%左右。

6) spark.shuffle.manager
参数说明:该参数用于设置ShuffleManager的类型( 默认值:sort)。Spark 1.5以后,有三个可选项:hash、sort和tungsten-sort。HashShuffleManager是Spark 1.2以前的默认选项,但是Spark 1.2以及之后的版本默认都是SortShuffleManager了。tungsten-sort与sort类似,但是使用了tungsten计划中的堆外内存管理机制,内存使用效率更高。
调优建议:由于SortShuffleManager默认会对数据进行排序,因此如果你的业务逻辑中需要该排序机制的话,则使用默认的SortShuffleManager就可以;而如果你的业务逻辑不需要对数据进行排序,那么建议参考后面的几个参数调优,通过bypass机制或优化的HashShuffleManager来避免排序操作,同时提供较好的磁盘读写性能。这里要注意的是,tungsten-sort要慎用,因为之前发现了一些相应的bug。

7)spark.shuffle.sort.bypassMergeThreshold
参数说明:当ShuffleManager为SortShuffleManager时,如果shuffle read task的数量小于这个阈值(默认是200),则shuffle write过程中不会进行排序操作,而是直接按照未经优化的HashShuffleManager的方式去写数据,但是最后会将每个task产生的所有临时磁盘文件都合并成一个文件,并会创建单独的索引文件。
调优建议:当你使用SortShuffleManager时,如果的确不需要排序操作,那么建议将这个参数调大一些,大于shuffle read task的数量。那么此时就会自动启用bypass机制,map-side就不会进行排序了,减少了排序的性能开销。但是这种方式下,依然会产生大量的磁盘文件,因此shuffle write性能有待提高。

8)spark.shuffle.consolidateFiles
参数说明:默认值:false,如果使用HashShuffleManager,该参数有效。如果设置为true,那么就会开启consolidate机制,会大幅度合并shuffle write的输出文件,对于shuffle read task数量特别多的情况下,这种方法可以极大地减少磁盘IO开销,提升性能。
调优建议:如果的确不需要SortShuffleManager的排序机制,那么除了使用bypass机制,还可以尝试将spark.shffle.manager参数手动指定为hash,使用HashShuffleManager,同时开启consolidate机制。在实践中尝试过,发现其性能比开启了bypass机制的SortShuffleManager要高出10%~30%。

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