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原创 python脚本风格

刚学习python,为了建立良好的习惯,先把书上的风格指南照抄份做个字典方便以后查询使用。#/user/bin/env python #1)起始行“this is a test module” #2)模块文档(文档字符串)import sys #3)模块导入import osdebug = True #4)全局变量定义class FooClass(object):

2020-08-04 16:35:55 108

原创 UTF-16BE编码的xml文件提取数据并做平滑曲线图

最近老板给了个xml文件想把里面的数据提取出来做个平滑曲线图,因为xml文件是utf-16be编码的,在notpad++编辑器打开是一堆乱码,哎,没办法先用perl进行转码然后提取数据再调用R作图,xml文件如下:...

2020-08-04 16:20:42 298

原创 perl函数substr应用举例

提供了参考序列,需要根据起始位置和终止位置提取参考序列上固定的碱基序列,碱基位置及参考序列如下表| 参考序列 |起始位置 |终止为止||NC_002645.1|293|12550||NC_006577.2|206|21753||NC_006213.1|210|21496||NC_005831.2|287|20475||NC_004718.3|265|21485||NC_019843.3|279|21514||NC_045512.2|266|21555|参考序列文件如下:| NC_0026

2020-08-04 15:45:37 342

空空如也

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