weixin_43654330的博客

原创 一个因bed文件异常导致deeptools画图报错的问题

进行deeptools画TSS区分布的情况时出现非整型变量的报错，写下博客提醒以后的自己 #报错ValueError: invalid literal for int() with base 10: ‘txStart’ ValueError: invalid literal for int() with base 10: 'txStart' 问题查找： ①先用bedtools的sort功能来排序，通过排序来找出存在字符变量问题的行 sortBed -i final_UCSC_GENCODE_hg38v32