mpi环境配置

单机上mpi环境配置

1.配置好ssh

命令如下：

在当前主机下，执行ssh-keygen，将提示密钥存放的目录，敲回车确定。提示输入密码，为了运行程序时方便，不需要输入密码，直接输入两次回车确认即可。

然后将共有密钥放在自己的认证密钥里，cd ~/.ssh     进入.ssh后执行 cp id_rsa.pub authorized_keys这样ssh 时不用输入密码了。

修改 /etc/hosts文件，从localhost localhost.localdomain下一行凯斯，填入需要运行MPI的所有节点名及其ip地址：

（本机ip） node1

（本机ip） node2

（本机ip） node3

（本机ip） node4

然后修改或者创建 /etc/hosts.equiv文件，将允许访问本节点进行mpi计算的所有其他节点填入，一行一个节点名。这一步是使本节点对其他结点放权，文件如下：

node1

node2

node3

node4

然后测试

若果不用输入密码，则配置成功。如果是新手，会遇到ifconfig问题，参考https://blog.csdn.net/sinat_35605242/article/details/80941483

 

2.安装mpich

我太难了，我可能是个🐖，，，windows的文件一直拖都拖不到Xshell,改了文件夹权限chmod 777还是不行，最后还是用MobaXterm_Personal_10.9才解决，我呜呜呜~~~~

 

安装包的解压
安装包所在的目录下，运行tar xzvf mpich-x.x.x.tgz。

 tar xzvf mpich.tar.gz

切换到解压出来的包目录下
cd mpich-x.x.x

cd mpich-1.2.7p1/

configure配置编译环境，我这里为它选择了一个安装路径。
./configure --prefix=/usr/local/mpich-x.x.x

./configure --prefix=/usr/local/mpi -rsh=ssh --disable-weak-symbols

缺少编辑器，按需求确认安装C、C++、F77和F90编译器即可。

yum install gcc gcc-c++ gcc-fortran kernel-devel -y

./configure --prefix=/usr/local/mpi -rsh=ssh --disable-weak-symbols

 

安装

make

make install

至此，mpich安装完成

下一步就要配置环境变量了（其实主要就是你要扒拉到你的安装文件夹下，看哪些文件夹比较重要的，要想办法添加到PATH中去。比如/usr/local/mpi/bin这个文件夹等等。）

分别将/usr/local/mpi/bin和/usr/local/mpi/man加入环境变量PATH和MANPATH中，只需要在目录/etc/profile.d中创建mpich.sh和mpich.csh这两个文件即可，它们分别对Bourne shell和C shell起作用，这两个文件的内容如下：

mpich.sh

 

mpich.csh

使该配置文件生效

cd /etc

source /etc/profile

授予全部权限（简单粗暴。。）

至此，环境变量的配置完成。

3.开发第一个MPI程序

太激动了，，，呜呜呜，要哭ｌｉａｏ

在当前文件夹里，建立一个　ｔｅｓｔ．ｃ文件，并编写代码

或者

在解压出来的MPI安装目录下有个examples文件夹，里面有若干示例程序可供测试。

• 编译测试
  使用cd命令切换到示例程序文件夹下，使用mpicc sendmany.c -o sendmany进行编译。
• 运行测试

mpirun -np N sendmany
这里的N改成一个常数，表示你要用来运行这个并行程序的节点。如果不是在集群环境上，一个CPU一个节点，进程数也就是一个，本地机子默认的编号就是0。你N的不同就是把程序跑N遍。

 

#include"mpi.h"
#include<stdio.h>
#include<math.h>
void main(int argc,char *argv[])
{
        int myid,numprocs;
        int namelen;
        char processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];
        MPI_Init(&argc,&argv);
        MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&myid);
        MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&numprocs);
        MPI_Get_processor_name(processor_name,&namelen);
        printf("Hello World!Process %d of %d on %s\n,myid,numprocs,processor_name");
        MPI_Finalize();
}