(脑肿瘤分割笔记:Part-Two)利用自集成,深监督的3D UNet神经网络进行脑肿瘤分割

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Title:Brain tumor segmentation with self-ensembled, deeply-supervised 3D U-net neural networks: a BraTS 2020 challenge solution.

摘要

方法

概述

神经网络架构

损失函数

图像预处理

 总结


Title:Brain tumor segmentation with self-ensembled, deeply-supervised 3D U-net neural networks: a BraTS 2020 challenge solution.

摘要

本文主要采用深度监督和随机加权法。从两个不同的训练管道训练两个独立的模型集成,并且每个模型都会产生一个脑肿瘤分割图。然后将每个患者的这两个预测结果映射合并,从而考虑每个集合对特定肿瘤区域的表现。

对于脑肿瘤分割的挑战在于描绘肿瘤的ET(增强肿瘤),TC(肿瘤核心),WT(整个肿瘤)。主要的评估指标是重叠指标和距离指标。常用的Dice相似系数(DSC)衡量两组之间的重叠,在与真实标签的比较上下文中,它可以被定义为为:

DSC=\frac{2TP}{2TP+FP+FN}

其中TP为真阳性(正确分类体素的数量),FP为假阳性,FN为假阴性,但是DSC这个度量对图像中的

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