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原创 冠状病毒颗粒有多大
新型冠状病毒正在以令人震惊的速度传播，希望大家少出门，家里蹲，保护自己也是保护他人。千万不要无知无畏觉得无所谓，千万不要无知无畏觉得无所谓，千万不要无知无畏觉得无所谓!冠状病毒颗粒有多大呢?这里带领大家从“大小”了解一下这个敌人。1 μm = 1000 nm水：0.275 nm葡萄糖：0.9 nm血红蛋白：6.5 nm抗体：12 nm核糖体：30 nm...
2020-03-23 17:26:44
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原创 系统生物学角度下的癌症转移
随着我们对癌症转移的深入研究，癌症转移不再被视为线性级联反应，而是作为一系列并发的，部分重叠的过程，因为成功转移的细胞在抛弃旧的行为时呈现新的表型。缺乏对这种复杂现象的系统性理解，我们就无法针对癌症转移开发有效的干预手段。面对这个问题 ，现在系统级实验和计算建模仍然是一个挑战。这里总结一下我们对于癌症扩散转移的系统水平认识[1]。癌症转移是一个动态的选择过程癌细胞存在渐变的不同表型状态，其...
2019-12-05 01:28:04
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原创 神奇的贝叶斯公式
引言贝叶斯法则以托马斯.贝叶斯命名，他研究如何计算二项分布的概率参数的分布。贝叶斯法则被世界广泛认识，得益于Richard Price的推广和宣传。Price编辑了贝叶斯的主要著作《An Essay towards solving a Problem in the Doctrine of Chances》，在1763年贝叶斯去世2年后发表在Philosophical Transactions ...
2018-12-13 22:27:44
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原创 人工智能大健康公司Arivale的倒闭
Arivale在今年宣布倒闭，大概是成立五年之后。要说Arivale，必须要说大佬Leroy Hood。Hood在科学仪器的开发、系统生物学和P4医学的贡献尤为突出。在科学仪器方面，Hood在1983年就发明了DNA合成仪，1986年开发了第一台自动化的DNA测序仪，这些仪器的出现迅速催生了人类基因组计划。事实上，早在1987年他就获得过Lasker基础医学研究奖。在系统生物学领域，Hood在20...
2019-10-09 16:55:06
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原创 全外显子测序助力疾病诊疗
患者是男性,最初在15个月时出现肛周脓肿和直肠炎，后面进展为全层结肠炎合并肠皮瘘，和克隆恩病极为相似。年龄和严重程度提示有免疫缺陷，但是详细诊查后依然不能确诊。脓肿扩大,自发排出,经过几轮抗生素治疗后未能关闭。他随后出现腹泻和体重减轻。他的病情在6个月内继续恶化,30个月转诊研究人员所在医院。他体重8.1公斤,身长81.2厘米,BMI为12.7, 表明严重发育迟缓和营养不良。研究人员采用罗氏N...
2019-09-24 14:21:06
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原创 机器学习里的欧氏距离
“远在天边，近在眼前”，距离是一个需要定义的概念，对距离进行量化需要一个合适的坐标参考体系。在诗句里，距离可以很浪漫，“世界上最遥远的距离，不是生与死的距离，不是天各一方，而是，我就站在你的面前，你却不知道我爱你”。在机器学习里，距离是严谨的，需要一个精确的公式来计算。许多机器学习的常见算法都需要用到距离函数，即用于计算两个不同观测（obs）之间的距离。以癌症组织的转录组测序数据为例，不同的癌...
2019-07-25 23:52:23
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原创 正常健康人组织也有癌基因和抑癌基因突变
大型癌症基因组计划如TCGA研究分析了各种类型癌症的基因组变异。很少的研究人员会关注正常组织中的基因突变。在今年6月份的Science杂志上发表了一项研究，科学家开发了一种新的方法，能够从转录组测序（RNA-seq）数据中更加精准的研究突变。这种方法被称为RNA-MuTect，这种方法能够用利用组织来源的RNA及配对的正常DNA来确定组织中的体细胞突变。采用这种方法，他们分析了GTEx项目中正...
2019-07-25 23:43:45
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原创 世卫GLOBOCAN 2018年全球癌症统计报告
随着人口老龄化加剧，癌症正在变成人类卫生健康的一个重要负担。简单的说，一方面，癌症越来越常见;另一方面，晚期癌症依然是非常难治的疾病。世界卫生组织国际癌症研究机构(IARC)发布的GLOBOCAN 2018报告对全球癌症发病率和死亡率提供了全局化的数据和可视化[1, 2]。这些癌症统计数据的估计方法大多基于原先开发的方法[3, 4]，只是更多的强调短期预测和对发病率/死亡率比值的建模。GLOB...
2019-06-04 21:06:47
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原创 癌症被诊断的时候有多少细胞
癌症往往起源于一个单细胞，通过不断的分裂复制以及微环境的塑造成长为一个实体(除外血液肿瘤)。那么当一个人身体的癌症可以被检测出来的时候，癌组织中有多少癌细胞呢?癌症的诊断方法包括：病理诊断、影像学诊断、液体活检等。显然不同的诊断方法可以在癌症发展的不同阶段将癌症检测到。是否可以早期诊断癌症事关癌症病人的预后，从量化角度分析癌症演化过程对于开发新的诊断方法意义重大。我们先看看体积为1立方厘米的癌...
2019-02-20 17:46:49
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原创 一个成年人有多少细胞
2016年10月，一些著名的科学家齐聚伦敦，商讨如何构建一个人类细胞图谱。这是一个宏伟的计划，它将从分子水平定义人体的每一种细胞类型，提供一个人体三维图谱。这个图谱将告诉我们不同细胞类型如何协作参与组织、器官和系统的构造与功能，以及哪些异常可以导致疾病的发生。完成这一野心勃勃的计划需要一个国际性的交叉学科团队：生物学家、临床医生、技术人员、物理学家、计算生物学家、软件工程师以及数学家。不过小Q今天...
2018-12-21 21:33:23
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空空如也
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