正常健康人组织也有癌基因和抑癌基因突变

大型癌症基因组计划如TCGA研究分析了各种类型癌症的基因组变异。很少的研究人员会关注正常组织中的基因突变。在今年6月份的Science杂志上发表了一项研究，科学家开发了一种新的方法，能够从转录组测序（RNA-seq）数据中更加精准的研究突变。这种方法被称为RNA-MuTect，这种方法能够用利用组织来源的RNA及配对的正常DNA来确定组织中的体细胞突变。

采用这种方法，他们分析了GTEx项目中正常组织的基因突变。研究人员分析了29不同组织的RNA序列以及GTEx数据库中488个人的配对DNA。结果显示，大部分人至少有一种组织中有携带基因突变的细胞克隆。尽管这些突变可能大部分是无害的，但是其中一些基因突变是发生在已知的癌基因和抑癌基因上。数据提示，这些基因突变最常见于皮肤、食道和肺组织，说明环境暴露因素对于体细胞突变的发生具有重大作用。

这项研究清楚的证实，人体内正常细胞的DNA并非完全一致的，一小群细胞携带有疾病相关的体细胞突变是非常普遍的。体细胞突变持续进行，在一些特定的时刻，细胞获得的体细胞突变使细胞获得微小的生长生存优势，这群细胞就会慢慢长成一个优势的小克隆。之后，这群细胞可能慢慢消失，或者获得更大的优势之后长成一个更大的克隆。目前我们依然不清楚这些小的变异细胞克隆对于正常人意味着什么。这些人后期患癌的可能性是不是增大了？有多大？我们不得而知。不过这些小群变异细胞的存在对于癌症早诊具有重要意义。

将来更加有意思的是，癌症到底从哪一开始称为癌症？携带有癌基因抑癌基因变异的微小细胞克隆不是癌症，那么一个群体要获得多少突变，要生长到多少细胞，要跨过哪些“阈值”才能被成为癌症？感兴趣的可以下载原文慢慢阅读。

参考：

[1] RNA sequence analysis reveals macroscopic somatic clonal expansion across normal tissues. Yizhak K, Aguet F, Kim J, Hess JM, Kübler K, Grimsby J, Frazer R, Zhang H, Haradhvala NJ, Rosebrock D, Livitz D, Li X, Arich-Landkof E, Shoresh N, Stewart C, Segrè AV, Branton PA, Polak P, Ardlie KG, Getz G. Science. 2019 Jun 7;364(6444).