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原创 生信分析Rstudio中Giotto包的安装与python路径配置的笔记

Giotto是一个面向空间转录组数据的R包,最大的优势是与空间信息紧密结合,但由于是基于Python构建的R包,给像我这样的初学者带来很大的麻烦。然后在Rstudio中配置python路径,因为R好像有一个低版本自带的r-miniconda,可能默认路径不是上述的python位置。在Rstudio中安装一个适配python的包reticulate,再配置路径。对了,好像还遇到一个问题,就是要求对应的语言必须要是英文,需要在R中修改一下。直接安装就ok,需要注意是安装在了对应python环境下。

2023-06-28 20:21:59 727

原创 R语言CellChat安装返回值不为0(本地安装)

现在,您已经成功地在R中本地安装了CellChat。您可以按照CellChat的文档和示例来使用它进行单细胞RNA测序数据分析。确保您的计算机已安装R语言。安装CellChat。

2023-03-20 19:41:35 3149

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